Classification des virus

Classification des virus

La classification des virus ne peut être intégrée à celle réalisée pour les êtres vivants du fait que les virus ne sont pas considérés comme vivants, car ne pouvant se reproduire par leurs propres moyens. C'est ainsi qu'il a été nécessaire de mettre au point une classification particulière.

Il en existe deux qui font autorité :

Ces deux méthodes de classifications ne sont pas antagonistes et peuvent tout à fait s'intégrer l'une à l'autre, car la classification de l'ICTV reprend certains critères de la classification Baltimore.

Aucune des classifications n'est censée être phylogénétique, car les virus ne partagent pas d'origine commune.

Sommaire

Généralités

Les formes variées des virus résultent du fait que l'un des deux brins d'ADN dans lesquels toutes les formes de vie cellulaire conservent leur information génétique est redondant, et que par conséquent les virus peuvent avoir des génomes à simple ou double brin. De plus, le génome de certains virus est formé d'ARN plutôt que d'ADN. L'ARN est présent dans les cellules comme intermédiaire lorsque les gènes sont traduits en protéines. Le génome des virus à ARN peut être codé dans deux directions différentes : soit les gènes sont stockés dans la direction 5'→3' (polarité positive ou +), comme celle dans laquelle les gènes sont codés dans l'ARN messager des cellules, soit ils sont stockés dans la direction opposée (polarité négative ou -).

La taxinomie des virus est similaire à celle des organismes cellulaires :

Ordre (-virales)
Famille (-viridae)
Sous-Famille (-virinae)
Genre (-virus)
Espèce

Cependant, le code de nomenclature géré par le Comité International sur la Taxinomie des Virus diffère des autres sur plusieurs aspects. Pour l'essentiel, les noms des ordres et des familles sont mis en italiques et les noms des espèces ne suivent pas la nomenclature binomiale mais sont souvent de la forme [Virus] de la [maladie]. La définition des ordres est très récente et a été délibérément lente ; à ce jour, seuls trois ont été nommés et la plupart des familles ne sont pas classées. Environ 80 familles et 4000 espèces de virus sont actuellement connues.

Classification par type de génome

Virus à ADN

L'information génétique de ces virus est stockée sous forme d'ADN.

Groupe I – Virus à ADN à double brin

Groupe II – Virus à ADN à simple brin

Virus à ARN

L'information génétique est stockée sous forme d'ARN.

Groupe III – Virus à ARN à double brin

    • Famille des Birnaviridae
    • Famille des Chrysoviridae
    • Famille des Cystoviridae
    • Famille des Hypoviridae
    • Famille des Partitiviridae
    • Famille des Reoviridae - exemples Rotavirus ou Orthoreovirus
    • Famille des Totiviridae
  • Genres non classés
    • Endornavirus - exemple Vicia faba endornavirus

Groupe IV – Virus à ARN simple brin à polarité positive (Virus (+)ssARN ou de type ARN messager)

Groupe V – Virus à ARN simple brin à polarité négative

Virus à ADN ou à ARN à transcription inverse

Groupe VI – rétrovirus à ARN simple brin

L'information génétique est codée sous forme d'ARN. Une enzyme associée au virus, la transcriptase inverse, crée de l'ADN à partir de l'ARN pour assurer la réplication dans une cellule hôte.

Groupe VII – Pararétrovirus à ADN double brin

L'information génétique est codée sous forme d'ADN. La réplication se base sur l'ARNm.

Classification par type de capside

Voir Capside

Voir aussi

Note et référence

  1. ↑ (en) Michael J. Adams, John F. Antoniw et Jan Kreuze, « Virgaviridae: a new family of rod-shaped plant viruses » sur Springer, Archives of Virology, 1er janvier 2009. Consulté le 1er novembre 2010.

Liens externes


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