- Protista
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Protista (Protistes)
Foraminifères benthiques Classification Domaine Eukaryota Divisions de rang inférieur - Rhodophyta (algues rouges)
- Chromista
- Stramenopiles (Heterokonta)
- Haptophyta
- Cryptophyta
- Alveolata
- Dinophyta (dinoflagellés)
- Apicomplexa (apicomplexés)
- Ciliophora (ciliés)
- Excavata
- Rhizaria
- Amoebozoa
- Opisthokonta
- Choanobionta
- Choanoflagellata (choanoflagellés)
- Choanobionta
- Autres groupes
Le terme protistes, créé par Ernst Haeckel[1] désigne les eucaryotes autres que les animaux (Métazoaires), champignons (Eumycètes), et plantes (des Embryophytes aux Archaeplastida, selon les définitions).
Ce groupe est très hétérogène, tant du point de vue anatomique que physiologique. Il réunit des organismes à organisation cellulaire dite simple, unicellulaires le plus souvent, multicellulaires parfois mais sans tissus spécialisés. Certains sont autotrophes (p. ex. : microalgues), d'autres sont hétérotrophes (p. ex. : protozoaires se nourrissant de microalgues).Les protistes sont un groupe paraphylétique dans la classification phylogénétique. Ils étaient, en classification classique, le quatrième règne du domaine des eucaryotes.
Constituant les bases du réseau trophique marin, ils jouent un rôle majeur dans les cycles biogéochimiques, les réseaux trophiques et ils constituent une part importante de la biodiversité et peut-être plus encore de la « biodiversité fonctionnelle » : sur environ 300 000 espèces estimées existantes, les 2/3 pourraient être assez largement distribuées, dans les océans notamment et 100 000 environ pourraient avoir une distribution plus restreinte[2].
Ils rendent d'importants services écologiques, en particulier pour l'épuration de l'eau, la régulation du CO2 et des minéraux dans l'eau, et la pêche, la récolte de coquillages et l'aquaculture).
Sommaire
Histoire
La première définition d'un règne des protista a été proposée par Ernst Haeckel en 1866 en regroupant tout ce qui à son sens et à l'époque ne correspondait ni aux végétaux (ou Plantae), ni aux animaux.
Le taxon de Protista a ensuite perduré pendant plus d'un siècle, mais la délimitation de ce « règne » a souvent et fortement varié en fonction des auteurs. Dans la classification phylogénétique moderne, il disparaît.
Les protistes sont des vivants unicellulaires dont la taille est d'environ 0,1mm, comme l'amibe, la paramécie et l'euglène[3].
Classification phylogénétique moderne
Au XXIe siècle, le caractère polyphylétique des protista, quelle que soit leur définition, a été démontré, réduisant considérablement la pertinence d'un tel groupe par ailleurs sans unité écologique ou morphologique.
La classification phylogénétique n'inclut pas le taxon protistes, rattachant certains organismes autrefois appelés sous ce nom aux Opisthocontes, d'autres à la lignée des algues brunes (Straménopiles) ou à la lignée verte des algues et plantes terrestres (Chlorophyta). D'autres « protistes » sont divisés en lignées monophylétiques qui pourraient avoir rang de règne. Enfin, la position d'autres « protistes » aux affinités incertaines est encore en cours d'étude. Au total, les scientifiques reconnaissent aujourd'hui une soixantaine de lignées[4],[5],[6].
Classification classique
Dans les anciennes classifications, le règne des protistes se divisait généralement en trois parties :
- les protozoaires, à affinités animales
- les protophytes, à affinités végétales
- les protistes fongiformes ou mycétozoaires ou protomycètes, à affinités avec le champignon
Protozoaires
Les protozoaires sont des organismes unicellulaires qui forment un groupe paraphylétique, ils possèdent une cellule eucaryote (c'est-à-dire possédant un vrai noyau, contrairement aux bactéries, dites procaryotes), très différenciée qui remplit de nombreuses fonctions nécessaires à la vie et comportant des organites complexes : « vacuoles pulsatiles », « cils », « flagelles ».
Les protozoaires se différencient donc fortement des cellules constituantes des tissus des métazoaires.
Ils ont conquis et se sont adaptés à tous les milieux de vie, et certains sont des parasites qui peuvent être dangereux. Leur reproduction sexuée ou asexuée est très complexe. Le mode de nutrition des protozoaires se fait par ingestion (phagocytose ou via un cytopharynx). Les protozoaires sont souvent hétérotrophes, c'est-à-dire qu'ils puisent leur source de carbone en provenance des différents composés organiques.On distingue cinq sous-embranchements :
- Les actinopodes qui émettent de fins pseudopodes rayonnants. Ils comprennent :
- Les acanthaires, qui sont des protozoaires marins et planctogéniques.
- Les radiolaires actinopodes, qui sont des protozoaires marins avec un squelette siliceux. Leur sédimentation et leur fossilisation donnent naissance à des roches telle le jaspe.
- Les héliozaires.
- Les cnidosporidies sont des parasites dont le stade initial est un germe amiboïde et le stade final une spore pourvue d'un filament évaginable.
- Les infusoaires ou infusoires sont des protistes de grande taille (jusqu'à 300 μm pour la paramécie). Ils sont munis d'un macronucléus et d'un micronucléus.
- Les rhizoflagellés qui comprennent les rhizopodes et les flagellés.
- Les rhizopodes constituent une superclasse de protozoaires caractérisés par leur aptitude à émettre des pseudopodes locomoteurs et préhensibles. On trouve dans cette classe les amibes, les radiolaires rhizopodes et les foraminifères.
- Les foraminifères se trouvent dans les eaux marines et saumâtres, et leur test calcaire comprend plusieurs loges plus ou moins perforées comme les globigérines et les nummulites.
- Les flagellés constituent une superclasse de protozoaires pourvus de flagelles qui sont des organes filiformes et contractiles qui assurent la locomotion. On trouve dans cette classe les phytoflagellés (végétaux chlorophylliens), et les zooflagellés, animaux dont certains peuvent être de dangereux parasites comme le Trypanosome qui cause la « maladie du sommeil ».
- Les rhizopodes constituent une superclasse de protozoaires caractérisés par leur aptitude à émettre des pseudopodes locomoteurs et préhensibles. On trouve dans cette classe les amibes, les radiolaires rhizopodes et les foraminifères.
- Les sporozoaires sont dépourvues à l'état adulte d'appareil locomoteur. Ce sont des parasites des cellules animales.
Protophytes
Les protophytes sont des organismes végétaux unicellulaires ou à cellules peu différenciées. On distingue sept sous-embranchements :
- Les Chlorophycées
- Les Dictyochophycées
- Les Euglénophycées
- Les Prymnésiophycées
- Les Chrysophycées
- Les Dinophycées
- Les Xanthophycées
Mycétozoaires
Ce sont des protistes qui possèdent de nombreuses caractéristiques communes avec les Mycètes. Par exemple : les myxomycètes.
Pathogénicité
Quelques espèces de protistes sont des pathogènes importants pour les animaux ou les plantes.
Par exemple- Plasmodium falciparum cause le paludisme chez l'homme,
- Phytophthora infestans est responsable d'une maladie de la pomme de terre.
- Giardia lamblia est un protozoaire parasite responsable de la giardiose chez les animaux et les humains.
- Cryptosporidium parvum est un protozoaire parasite responsable de la cryptosporidiose chez les mammifères.
Une compréhension plus approfondie de la biologie des protistes pourrait permettre de mieux contrôler ces maladies.
Enjeux écologiques
- La plupart des protistes et leur grande diversité jouent un rôle a priori essentiel[7] dans les grands cycles biogéochimiques, et dans la productivité biologique des zones côtières, estuariennes et océaniques[8], et donc dans le puits de carbone océanique. Les services écosystémiques qu'ils rendent pourraient être affectés par le double phénomène d'acidification des océans et de réchauffement climatique (Cloern et Jasby, 2008; de Young et al. , 2004).
- Certaines espèces pullulent en condition d'eutrophisation, de déséquilibre trophique (déséquilibres du système prédateur-proie) ou de réchauffement (Efflorescence algale). Quelques espèces (Phaeocystis) sont suivies en raison des toxines qu'ils produisent, qui peuvent rendre non consommables les coquillages filtreurs.
- Certaines espèces sont considérées comme bioindicatrices de l'état de l'écosystème et sont à ce titre suivies par divers réseaux d'observations, côtiers notamment, pour mieux comprendre les phénomènes d'eutrophisation, zones mortes, intoxications alimentaires et/ou suivre le changement climatique afin d'en mieux anticiper les effets et de s'y adapter.
Notes et références
- Via l'allemand Protist, cf TLFi
- Wilhelm Foissner ; Protist diversity and distribution: some basic considerations ; Revue : Biodiversity and Conservation ; Éditeur : Springer Netherlands ; Volume 17, Number 2 / février 2008 ; Pages 235-242 ISSN:0960-3115 (Print) ; ISSN:1572-9710 (Online) ; DOI:10.1007/s10531-007-9248-5
- F.E.Se.C.
- Patterson, D. J. (1999). The diversity of eukaryotes. American Naturalist 154: S96-S124.
- Cavalier Smith, T. & Chao, E. E. Y. (2003). Phylogeny and classification of phylum Cercozoa (Protozoa). Protist 154: 341-58.
- Adl, S. M. et al. (2005). The new higher level classification of eukaryotes with emphasis on the taxonomy of protists. Journal of Eukaryotic Microbiology 52: 399-451.
- John O. Corliss ; Why the World Needs Protists ! ; Journal of Eukaryotic Microbiology ; Volume 51 Issue 1, Pages 8 - 22 ; Online: 11 Jul 2005
- Guarini JM, Cloern JE, Edmunda J, Gros P (2002) Microphytobenthic potential productivity estimated in three tidal embayments of the San Francisco Bay: a comparative study. Estuaries 25:409–417
Voir aussi
Bibliographie
- T. Cavalier-Smith (Department of Botany, University of British Columbia, Vancouver, Canada) ; Kingdom protozoa and its 18 phyla. ; Microbiol Mol Biol Rev. 1993 December; 57(4): 953-994 ; Résumé ;
Articles connexes
Liens externes
- Les protistes (UQAM)
- Antoine Morin, « Les protozoaires », Université d'Ottawa
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