Champignon aquatique

Les champignons vivant dans les zones humides sont très nombreux mais les champignons strictement aquatiques sont rares et essentiellement connus dans les eaux douces où ils contribuent notamment à dégrader le bois-mort immergé et les feuilles mortes, servant également de nourriture à de nombreux invertébrés qui les consomment. On peut aussi les trouver dans les creux de bois-mort qui ont accumulé de l'eau.

Clavariopsis aquatica

Les champignons sont pour la plupart aérobie, c'est-à-dire qu'ils ont des besoins en oxygène peu compatibles avec la vie sous l'eau étant donné leur absence d'organe respiratoire adapté. Quelques espèces, appartenant notamment aux groupe chytridiomycota (ou 'chytrides^[1] ou Chytridiomycètes) ; une des quatre grandes divisions du règne fongique) peuvent avoir un cycle aquatique. La plupart sont des décomposeurs mais certains sont des pathogènes de plantes aquatiques, invertébrés, poissons ou amphibiens qui s'en défendent normalement par des composés fongicides ou protecteurs produits dans leur mucus.

Les thalles des chytrides ne forment pas de vrai mycélium et certaines espèces sont unicellulaires.

Certaines espèces sont des symbiotes d'animaux, par exemple les Neocallimastigales font partie du microbiote (ici actives dans le rumen) des herbivores ruminants chez lesquels ils contribuent à la dégradation de la cellulose.

Les champignons aquatiques et leurs fonctions écosystémiques sont mal connus, hormis pour quelques espèces pathogènes plus étudiées.

Histoire

Les chytrides sont un groupe très ancien. Ils sont la base phylogénétique probable de tout le règne fongique, c'est-à-dire ancêtres probables des Zygomycota puis des Ascomycota et Basidiomycota.

Reproduction

Toutes les espèces de chytrides produisent des spores mobiles (dits « zoospores ») à un flagelle capables de nager dans l'eau ou dans un liquide de densité proche (on les dit uniflagellés); c'est un fait unique dans le règne des mycètes.

Alimentation

Ce sont des espèces saprophytes et pour certains des parasites.
Nombre d'entre eux, grâce à des protéases (ex : kératinase des champignons kératinophiles et/ou kératinolytiques, c'est-à-dire qui dégradent la kératine) qu'ils produisent peuvent dégrader la chitine et la kératine des carapaces, écailles et phanères (ongles, griffes, cornes, poils) et de la peau d'organismes aquatiques (ou non), morts ou parfois vivants (dans ce dernier cas on les dits alors pathogènes, mais il peut s'agir d'une infection opportuniste suite à une blessure ou une déplétion immunitaire par exemple).

Classification

Il n'existe pas de classification spécifique pour les champignons aquatiques (qui ne constituent pas un groupe taxonomique), mais le groupe des chytrides qui rassemble la plupart des champignons aquatiques a été subdivisé en cinq ordres

Pathogénicité

• Une espèce ( Batrachochytrium dendrobatidis) cause la chytridiomycose, une maladie infectieuse occasionnant la mort des amphibiens en bloquant leurs organes respiratoires (phénomène reconnu depuis 1998, en Australie et à Panama qui a été soupçonné comme co-facteur explicatif de mortalités importantes et anormales d'amphibiens).
• Quelques espèces peuvent s'attaquer à des plantes cultivées et riches en eau, comme le maïs et la luzerne, ou à un certain nombre d'autres plantes ; ce sont des parasites endocellulaires.

Voir aussi

Articles connexes

• Mycota
• Mastigomycota

Références externes

• Référence Index Fungorum : Chytridiomycota (en)
• Référence Index Fungorum : Chytridiomycetes (en)
• Référence NCBI : Chytridiomycota (en)

Liens externes

• Chytrid Fungi Online : site sur les champignons chytrides (en)
• (en) Zoosporic Fungi Online : site sur les champignons (et les organismes "ex-champignons") possédant des zoospores

Bibliographie

• C T Ingold, Guide to Aquatic Hyphomycetes, 1975, Ed : Freshwater Biological Association, (ISBN 0900386223), (ISBN 978-0900386220), (illustré de dessins en noir & blanc), 96 p (Lien)

Notes et références

• Portail de la mycologie