- Liaison peptidique
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Une liaison peptidique est une liaison covalente formée entre un atome de carbone d'un acide aminé et un atome d'azote d'un autre acide aminé. La liaison peptidique correspond à une fonction amide dans le cas particulier de certaines molécules biologiques.
Sommaire
Formation de la liaison peptidique
La liaison est le résultat de la réaction entre la fonction acide carboxylique COOH du premier acide aminé et la fonction amine NH2 du deuxième, avec comme produit secondaire une molécule d'eau H2O.
La liaison peptidique est fondamentale dans la formation des peptides, des polypeptides et des protéines. Après la constitution de la liaison peptidique, une extrémité est porteuse d'un groupe amine libre - l'extrémité N - ou amino-terminale, et l'autre d'un groupe carboxyl - extrémité C- ou carboxyl-terminale.
Configurations de la liaison peptidique
La liaison peptidique peut exister sous deux configurations : cis et trans. Cependant, dans la forme cis, les chaînes latérales et les atomes de carbone alpha de résidus adjacents se gênent mutuellement et, du fait de cet encombrement stérique, le rapport cis/trans est de l'ordre 1:1000. Une exception notable de cette règle est la proline, pour laquelle la forme atypique du groupe latéral rend la configuration cis plus accessible[1].
Propriétés de la liaison peptidique
- Stabilité
Structures limites de la forme de résonanceLa liaison peptidique est stabilisée par mésomérie et ne peut subir de libre rotation, propriété très importante dans l'établissement de la conformation tridimensionnelle des chaines polypeptidiques. Cette résonance implique la planéité de la liaison peptidique.
De cette structure, il découle que les groupements R des deux acides aminés reliés par la liaison peptidique sont alternés de part et d'autre de la liaison peptidique.
- Longueurs et angles
Longueurs et angles de la liaison peptidiqueLa longueur d'une liaison peptidique est de 1,33 Å = 133 pm (= 1,33.10-10 m). Elle est donc plus courte qu'une liaison simple ordinaire mais plus longue qu'une liaison double.
Rupture de la liaison peptidique
Les liaisons peptidiques peuvent être cassées par protéolyse grâce à des enzymes appelées peptidases.
Références
- L'Actualité chimique, juillet 2002, p. 12
Voir aussi
Wikimedia Foundation. 2010.
