Mycobactérie

Mycobacteriaceae
Culture de Mycobacterium tuberculosis
Classification classique
Règne	Bacteria
Embranchement	Actinobacteria
Ordre	Actinomycetales
Sous-ordre	Corynebacterineae
Famille
Mycobacteriaceae — auteur incomplet —, date à préciser
Genres de rang inférieur
Mycobacterium Nocardia Rhodococcus
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Les mycobactéries (la famille des Mycobacteriaceae) sont des bacilles fins, quelquefois incurvés, ne se décolorant ni sous l'action des acides forts, ni sous l'action de l'alcool.

Les mycobactéries sont ainsi définies comme des « bacilles acido-alcoolo-résistants » ou BAAR.

Sommaire 1 Propriétés d'enveloppe 2 Écologie 2.1 Habitat 2.2 Pouvoir pathogène 3 Caractères morphologiques 3.1 Morphologie microscopique 3.2 Coloration 4 Culture 5 Caractéristiques biochimiques et génétiques

Propriétés d'enveloppe

La propriété d'acido-alcoolo-résistance est liée à la structure même de leur paroi cellulaire qui forme une véritable enveloppe cireuse et protectrice du fait de sa richesse exceptionnelle en acides gras et lipides (23 % pour 1-2 % chez les autres germes).

Le squelette de la paroi est composé de peptidoglycane (appelé aussi muréine) relié de façon covalente à un hétéroside : l'arabinogalactane, lui même estérifié par des acides mycoliques, acides gras particuliers à très longue chaine. Ils forment alors des cires.

La présence de ces cires de mycolates d'aribinogalactane dans la paroi fixées sur le peptidoglycane est cause de l'AAR par :

• L'hydrophobie importante qui rend difficile la pénétration des agents colorants et décolorants.
• La fixation de la fuchsine sur les acides mycoliques, fixation qui retiendrait de plus la fuchsine qui a pénétré dans le bacille.

La couche externe, sorte de capsule, est de composition et structure complexes. On estime aujourd'hui qu'il y a :

• Une couche externe constituée de polyosides et de protéines (dont une alanine déshydrogénase) et de quelques lipides dont la nature reste encore un mystère (lipoprotéine?)
• Une couche interne beaucoup plus riche en lipides.

Écologie

Elles sont intracellulaires obligatoires et peuvent survivre un an dans les fèces des bovins et sur le sol.

Habitat

Ces bactéries se rencontrent dans la nature où elle vivent en saprophytes, mais également chez l'Homme et les animaux où elles se comportent soit en commensales soit en pathogènes. Quelques espèces sont pathogènes strictes pour l'homme et d'autres pour l'animal.

Pouvoir pathogène

Les mycobactéries pathogènes strictes sont responsable de maladies spécifiques:

• Mycobacterium leprae est responsable de la lèpre ;
• Les quatre espèces M. tuberculosis, M. bovis, M. avium et M. africanum sont regroupées sous le nom de bacilles tuberculeux et sont responsables de la tuberculose (on désigne parfois M. tuberculosis comme un synonyme de bacille tuberculeux, mais il s'agit bien d'une espèce à part entière) ;
• Mycobacterium bovis est l'agent responsable des tuberculoses bovines, mais se retrouve dans quelques rares cas d'infections humaines.
• Mycobacterium avium est l'agent de la tuberculose aviaire.
• Les mycobactéries "atypiques" présentent de nombreuses espèces saprophytes mais aussi quelques espèces pouvant provoquer chez l'homme soit des infections locales (cutanées ou ganglionnaires), soit des syndromes pseudo-tuberculeux.
• Mycobacterium paratuberculosis ou bacille de Johne est l'agent d'une entérite des bovidés.

Caractères morphologiques

Morphologie microscopique

Les mycobactéries se présentent comme des bacilles fins, légèrement incurvés voire ramifiés. Ils sont immobiles, dépourvus de spores. Ils n'ont pas de capsule à proprement parler.

Coloration

Ces bactéries se colorent très mal par les techniques conventionnelles, leur paroi riche en lipides rendant difficile la pénétration des colorants.

Après coloration de Gram ils apparaissent quelque fois Gram positif mais sont le plus souvent non observables. Cette coloration classique ne présente donc pas d'intérêt pour leur étude.

Des techniques spéciales ont été mises au point pour mettre en évidence le caractère d'acido-alcoolo-résistance, c'est la technique de référence de Ziehl-Neelsen où les bacilles colorés à chaud par la fuchsine de Ziehl conservent alors leur coloration rouge sous l'action combinée d'un acide fort et d'alcool. D'autres colorations ont aussi fait leur apparition : la coloration de Kinyoun et la coloration à l'auramine. c'est une coloration qui peut être faite en 15 min environ. L'interprétation des résultat ne doivent pas être confondu avec ceux d'une coloration de gram ! à la coloration de gram, le résultat pour une bactérie gram + est violet; alors qu'avec la coloration de Kinyoun, le résultat pour un gram + est ROSE !

Culture

Les mycobactéries se différencient fondalementalement par leurs caractères structuraux :

• Les bacilles tuberculeux (Mycobacterium tuberculosis, M. bovis, M. africanum) ne cultivent que sur milieux adaptés (milieu Lowenstein-Jensen) aux mycobactéries, incubés à 37°C; les cultures sont lentes et non pigmentées (12 à 14 jours d'incubation minimum).
• Les mycobactéries atypiques présentent des exigences moindres : elles peuvent cultiver à des températures inférieures à 37°C et parfois même sur milieux usuels.
• Le bacille de la lèpre (Mycobacterium leprae) ne cultive sur aucun milieu.

Les cultures se présentent généralement comme des colonies mates, peu bombées, irrégulières et d'aspect sec : de type Rough. Les Mycobacterium tuberculosis présentent une irrégularité atypique : elle est dite en « chou-fleur ».

Caractéristiques biochimiques et génétiques

Ce sont des aérobies strictes, parfois microaérophiles à l'isolement. Elles sont très résistantes à la dessiccation allant jusqu'à quelques années de survie à l'état desséché et au froid. Les mycobactéries résistent aux antiseptiques hydrosolubles (mais sont sensibles aux produits liposolubles, comme alcool, éther). Elles résistent aux enzymes des phagocytes (les lysosomes ne contiennent que peu de lipases). On observe chez les mycobactéries un ralentissement des échanges nutritifs : alors que la plupart des microbes pyogènes se divisent une fois toutes les 10 à 20 minutes, le bacille tuberculeux se divise une fois toutes les 10 à 20 heures tandis que celui de la lèpre se divise une fois tous les 20 jours. Ceci explique le caractère beaucoup plus lent et chronique des mycobactérioses.

Le génome de Mycobacterium tuberculosis a été entièrement séquencé : elle possède un chromosome circulaire de 4 411 529 paires de bases (GC%=65.6) pour 3924 gènes.
Un gène particulier semble essentiel au pouvoir pathogène chez l'Homme, gène absent chez le BCG et Mycobacterium microti. Il s'agit d'un gène codant une protéine ESAT-6, sécrétée par la bactérie et déclenchant une forte production d'INF-Gamma.

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