- Actynomycète
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Actinobacteria
Actinomycètes
Culture de Mycobacterium marinum Classification classique Règne Bacteria Division Actinobacteria
Margulis, 1974Classe Actinobacteria
Stackebrandt, Rainey & Ward-Rainey 1997Ordres de rang inférieur Sous-classes : - sous-classe des Acidimicrobidae
- ordre Acidimicrobiales
- sous-classe des Actinobacteridae
- ordre Actinomycetales
- ordre Bifidobacteriales
- ordre Nitriliruptorales
- sous-classe des Coriobacteridae
- ordre Coriobacteriales
- sous-classe des Rubrobacteridae
- ordre Rubrobacterales
- ordre Solirubrobacterales
- ordre Thermoleophilales
Classification phylogénétique Position :
- Eubactéries
- Protéobactéries
- groupe :
- Firmicutes
- groupe Bacillus / Clostridium
- Actinobactéries
- groupe :
- Firmicutes
- groupe :
- Bactéries vertes sulfureuses
- groupe :
- Flavobactéries
- Bactéroïdes
- groupe :
- Planctomycétales
- Bactéries vertes non sulfureuses
- Aquificales
- Thermotogales
Streptomyces sp.
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Les actinomycètes (Actinobacteria Lynn Margulis, 1974) sont un groupe de bactéries Gram-positives. La plupart d'entre elles se trouvent dans le sol, et elles comprennent quelques-uns des principaux acteurs de la vie du sol, y jouant un rôle important dans la décomposition des matières organiques, comme la cellulose et la chitine. C'est le regroupement des bactéries sous forme d'« arbre » qui utilise ses cysts (fruits), ici des endospores, afin de résister à un milieu nutritif défavorable (par exemple, présence de myxomycètes dans le milieu).
Le groupe des actinomycètes et nocardias est à cheval entre microbes et champignons. Il est décrit par certains parmi les mycoses, par d'autres parmi les infections bactériennes. Il se rapproche des champignons par l'existence de filaments ramifiés et des bactéries par la finesse de ces filaments (maximum 1 micron, les filaments mycéliens allant de 2 à 5 microns) et par le fait que, en culture surtout, ces filaments se fragmentent au point de ressembler beaucoup à des bacilles (aspect simlaire à celui des corynaebactéries). Par ailleurs, la composition de leur paroi et corrélativement leurs sensibilité aux antibiotiques les rapprochent davantage des bactéries.La majorité des espèces sont saprophytes ou commensales ; quelques unes peuvent être pathogènes chez des individus à résistance affaiblie.
Les actinomycètes sont anaérobies tandis que les nocardias (et streptomycètes qui leur ressemblent) sont aérobies.
Sommaire
Actinomycose
Écologie, rôle pathogène et épidémiologie
Actinomyces israelii est l'agent de l'actinomycose humaine, il est assez proche mais distinct d'actinomyces bovis, agent de l'actinomycose bovine. A. israelii est normalement présent comme commensal de la bouche (surtout tartre dentaire), au niveau des amygdales et dans l'intestin.
L'infection endogène due à sa pénétration dans les tissus provoque des abcès indurés subaigus ou chroniques, dont le centre se nécrose et dont le pus ainsi formé finit par s'éliminer par une ou plusieurs fistules. La localisation peut être cervico-faciale (plus ou moins 45 % des cas, surtout joues et tissus sous maxillaires), abdominale (plus ou moins 25 % des cas, surtout du coecum), pulmonaire (plus ou moins 20 %) ou variée (notamment glandes lacrymales).
La caractéristique principale de ces suppurations est la présence de petits grains jaunâtres. Dans les lésions fistulisées, il y a généralement surinfection par des coques anaérobies, des staphylocoques ou des petits bacilles Gram négatifs appelés Actinobacillus actinomycetemcomitans.
Caractères bactériologiques
Morphologie
Dans le produit pathologique, on ne trouve l'actinomyces que dans les grains. Ceux-ci, écrasés entre lame et lamelle, se révèlent constitués d'un feutrage de fins filaments ramifiés se terminant en périphérie par des renflements en massue. Au Gram, les filaments sont Gram positifs, les massues Gram négatives.
Dans les préparations faites à partir des cultures, on trouve des fragments de filaments de longueurs très variables, beaucoup de formes bacillaires et on recherche les formes bifurquées.
Culture en anaérobiose
- Sur gélose au sang, il y a développement lent (5 à 15 jours) de petites colonies blanchâtres, rugueuses et avec des prolongements en pattes d'araignées (plus lisses pour A. bovis qui est d'ailleurs plus tolérant pour l'oxygène).
- En milieu liquide, on peut voir de petites sphères floconneuses.
Diagnostic
Il faut soigneusement rechercher les grains jaunes qui peuvent être très petits et rares (surtout quand il y a surinfection). Faire couler lentement le pus le long de la paroi du tube ou d'une boîte de Pétri en le regardant à la loupe. Les examens doivent porter sur ces grains écrasés : examen microscopique et culture.
Traitement
Pénicilline, sulfamidés et tétracyclines sont relativement actifs mais le traitement doit être prolongé et s'accompagner au besoin de drainage chirurgical.
Nocardioses
Écologie, rôle pathogène et épidémiologie
Nombreuses espèces saprophytes, surtout telluriques. Quelques unes peuvent provoquer des infections, notamment :
- Nocardia astéroïdes qui provoque assez rarement des infections pulmonaires pseudo-tuberculeuses surtout chez des individus atteints d'emphysème ou de bronchiectasies. On le retrouve également dans des abcès cérébraux.
- Nocardia brasiliensis, nocardia madurae,... se partagent avec des champignons vrais (Monosporium apiospermum), l'étiologie des mycetomes ou maduramycoses : abcès sous-cutanés, granulomateux, chroniques, survenant surtout aux membres inférieurs, dans les régions tropicales (Indes, Amérique du Sud). Le pus contient des grains de couleurs variables d'après les espèces (blancs, jaunes, rouges, noirs).
Caractères bactériologiques
Morphologie
Filaments de longueur très variable, parfois très courts (bacilloformes), plusieurs espèces sont partiellement acido-résistantes (difficulté du diagnostic différentiel de la tuberculose en cas de nocardiose pulmonaire).
Culture
Développement lent (2 à 4 semaines) de colonies rugueuses, plissées, souvent pigmentées.
Diagnostic
Examen microscopique et culture. (Recherche des formes bifurquées).
Traitement
Le même que celui de l'actinomycose.
Principaux genres
- Actinomyces
- Arthrobacter
- Corynebacterium
- Frankia
- Micrococcus
- Micromonospora
- Mycobacterium
- Nocardia
- Propionibacterium
- Streptomyces
Références
- E. Stackebrandt, F.A. Rainey, N.L. Ward-Rainey, Proposal for a new hierarchic classification system, Actinobacteria classis nov. Int. J. Syst. Bacteriol. (1997) 47:479-491. Résumé
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