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Entérovirus
Poliovirus, le virus de la poliomyélite Classification des virus Type Virus Groupe Groupe IV Famille Picornaviridae Genre Enterovirus Les entérovirus sont des virus non-enveloppés à ARN simple brin de polarité positive. Ils appartiennent à la famille des Picornaviridae.
Le terme « Enterovirus », qui désigne un genre viral, est à distinguer de celui de « virus entérique » qui désigne un virus entrant dans l'organisme en passant par le système gastro-intestinal et s'y développant. Par exemple, les Rotavirus sont des virus entériques qui n'appartiennent pas au genre Enterovirus.
Les entérovirus ont été découverts par le Docteur David Tyrrell.
Sommaire
Liste des espèces
- Entérovirus bovin
- Entérovirus humain A
- Entérovirus humain B
- Entérovirus humain C
- Entérovirus humain D
- Entérovirus humain E
- Poliovirus
- Entérovirus porcin A
- Entérovirus porcin B
Morphologie des virions
La capside est non-enveloppée, à symétrie icosaédrique, d'un diamètre de 27 à 30 nm. Elle est formée de 60 protomères, tétramères impliquant chacun un exemplaire des protéines structurales du virus (VP1, VP2, VP3 et VP4). La protéine VP4 n'est pas exposée à la surface de la particule virale. La capside virale comporte une dépression, appelée « canyon », qui contient le site d'attachement aux récepteurs cellulaires. La nucléocapside contient une molécule unique d'ARN génomique.
Génome
Le génome est constitué d'une molécule unique d'environ 7 500 nucléotides, contenant un seul cadre de lecture fonctionnel flanqué de deux région non codantes, impliquées dans la régulation de la traduction et de la réplication du génome. Le génome viral est polyadénylé à son extrémité 3' et son extrémité 5' est liée de façon covalente à une petite protéine virale appelée VPg.
Après la décapsidation qui suit l'infection d'une cellule, la molécule d'ARN est directement prise en charge par la machinerie de traduction cellulaire qui va synthétiser l'ensemble des protéines virales. Sur la partie 5' du cadre de lecture se trouvent les séquences codant les 4 protéines structurales du virus (VP1 à VP4) qui forment la capside en aval desquelles se trouvent les séquences codant les protéines non structurales dont certaines contiennent des domaines enzymatiques (protéases, hélicase, ARN-polymérase ARN-dépendante).
Classification
Actuellement, il existe 10 espèces d'entérovirus [1]: les entérovirus humains A à D (HEV-A à D), les entérovirus simiens A, les entérovirus bovins, les entérovirus porcins A et B et les rhinovirus A et B. Ces espèces sont définies selon des critères phylogénétiques basés sur la partie du génome codant les protéines structurales. De ce fait, elle ne recouvre pas la classification antérieure, reposant sur des propriétés phénotypiques des virus (pouvoir pathogène, capacité à infecter certains types de cellules) à l'origine des groupes coxsackie A et B et echovirus [2].
Les analyses phylogénétiques actuelles conduites sur de nombreux virus circulant conduisent à l'identification de nouveaux génotypes et sont à l'origine de certaines modifications de la classification des entérovirus. Ainsi, les sérotypes de poliovirus sont désormais inclus dans l'espèces HEV-C. De même, la création d'une troisième, voire d'une quatrième espèce, de rhinovirus (HRV-C et -D) est elle discutée actuellement [3].
Par ailleurs, la nomenclature actuelle, définie avant l'apparition des techniques de biologie moléculaire, peut-être source de confusion. Ainsi, certains entérovirus simiens appartiennent à l'espèce HEV-B (Human enterovirus species B). De même, certains echovirus (Enterovirus Cythopatogenic Orphan Viruses), initialement réputés non-pathogènes pour l'Homme ("orphan" signifiant ici "non-pathogène") peuvent entraîner des manifestations cliniques plus ou moins sévères. Enfin, le nom même du genre "Enterovirus" suggère que tous les virus du genre sont des virus entériques, ce qui n'est pas le cas des rhinovirus par exemple ; pour pallier ce dernier problème, certains auteurs ont proposé de modifier le nom du genre en Rhinenterovirus.
Epidémiologie
Les entérovirus sont responsables d'un large spectre de symptômes, bénins ou sévères: paralysies flasques aiguës, méningites aseptiques, syndrome pieds-mains-bouche, angine, maladies respiratoires, cardiopathies aiguës ou chroniques, diarrhées, pancréatites, atteintes oculaires, encéphalites...[4]
Le sujet infecté émet des virus dans ses selles et la transmission est interhumaine par voie aérienne, par contact (mains sales) ou par de l'eau souillée, par des fruits ou légumes lavés à l'eau souillée, par des coquillages... Les entérovirus responsables de conjonctivites hémorragiques aigües (notamment certains variants d'HEV-70 et de CV-A24) pourraient être transmis directement par contact avec les sécrétions oculaires.
Les entérovirus, virus non-enveloppés, survivent relativement longtemps dans le milieu extérieur et en particulier dans l'eau.
Entérovirus 71 (HEV-71)
Chine
Entre 1999 et 2004, il n'y eut pas d'épidémie de syndrome pieds-mains-bouche à Shenzhen en République populaire de Chine, mais chaque année, il y eut localement de petites éruptions épidémiques associées avec quelques cas de maladies neurologiques sans mortalité rapportée. L'analyse génétique a révélé 19 cas d'HEV-71 parmi 147 enfants qui ont contracté le syndrome pieds-mains-bouche à Shenzhen durant cette période[1].
Jusqu'en 2008, aucune grande épidémie d'HEV-71 n'a été rapportée en Chine continentale, mais des infections sporadiques étaient communes dans le secteur côtier du sud-est de même que les régions intérieures, comme Pékin, Chongqing et Jinan. De 1998 à 2004, le seul virus HEV-71 identifié en Chine continentale a appartenu au génotype C4, indiquant une bien moindre variété en Chine qu'à Taïwan[1].
Le 3 mai 2008, les autorités de santé chinoises ont rapporté une éruption majeure de l'entérovirus HEV-71 dans la ville de Fuyang (province d'Anhui, chinois : 阜阳) et d'autres régions des provinces d'Anhui, du Zhejiang, et de Guangdong. À compter du 3 mai 2008, 3736 cas principalement chez des enfants ont été rapportés, avec 22 morts et 42 présentant des formes critiques de la maladie. Quelque 415 nouveaux cas ont été rapportés dans les dernières 24 heures dans la seule ville de Fuyang[2],[3]. À partir du 5 mai 2008, 6300 personnes ont été touchées par l'éruption virale qui a tué un autre enfant à Zhejiang, élevant le bilan des morts à 26 enfants, avec 1 198 autres enfants affectés dans cette seule province. En particulier, 5151 cas supplémentaires ont été rapportés dans la province d'Anhui avec des scores de plus de 4 dans les autres provinces. Au total, 8531 cas d'enfants infectés avec le syndrome pieds-mains-bouche (SPMB) ont été rapportés en Chine. Tous les enfants infectés avaient moins de 6 ans, et la plupart d'entre eux, moins de 2 ans[4],[5],[6]. Depuis le 7 mai, le SPMB contagieux a entraîné 28 morts[7]. Xinhua a rapporté que le nombre de personnes infectées s'est accru de 4000 à 15 799[8]. Jeudi, le bilan des morts a augmenté de 2 atteignant 30, alors que le nombre de cas rapportés augmentait à 19 962[9],[10]. Vendredi, il augmenta de 4 à 34, pour atteindre 43 le 16 mai, alors que le nombre de cas d'infections rapportés augmentait à 24 932[11],[12].
Dans la ville de Jian'ou de la province de Fujian, du 1er au 17 octobre 2008, Xinhua a rapporté que 3 enfants, tous âgés de moins d'1 ans étaient morts, et 110 autres étaient malades en raison du virus du bébé, ou du syndrome pieds-mains-bouche. Dans Anhui, le sud de la Chine, le virus a tué 42 personnes au mois d'avril et de mai, et 27 500 cas de bébés ont été rapportés. Les éruptions épidémiques avaient été reliées avec l'entérovirus 71, et il n'y a pas de vaccin pour la maladie[13],[14].
Vaccins
Aucun vaccin n'est actuellement disponible contre les entérovirus, hormis la poliomyélite. Le respect des règles générales d'hygiène et le lavage fréquent des mains sont probablement le moyen le plus efficace de réduire la propagation de ces virus.
Notes et références
- Li L, He Y, Yang H, et al., « Genetic characteristics of human enterovirus 71 and coxsackievirus A16 circulating from 1999 to 2004 in Shenzhen, People's Republic of China », dans J. Clin. Microbiol., vol. 43, no 8, 2005, p. 3835–9 [texte intégral, lien PMID, lien DOI]
- China on alert as virus spreads BBC News
- China orders heightened efforts to stop deadly virus AP News
- news.bbc.co.uk, China virus toll continues rise
- www.inthenews.co.uk, Hand-foot-mouth epidemic continues to infect children across China
- ap.google.com, China says 6,300 cases in viral outbreak
- news.xinhuanet.com, Xinhua's tally: Death toll of hand-foot-mouth disease rises to 28 in China
- www.theaustralian.news.com.au, 28 Chinese children die from virus
- ap.google.com/, Death toll from child viral disease up to 30 in China
- uk.reuters.com, China reports two more deaths from child virus
- ap.google.com, Report: Child viral death toll up to 34 in China
- ap.google.com/article, China child virus death toll up to 43
- africa.reuters.com, Toddler virus flares up again in China
- ap.google.com, Child virus kills 3, sickens 110 in east China
Quelques entérovirus
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