- Chlorobacteria
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Chlorobacteria
Chloroflexus Classification Règne Bacteria Sous-règne Negibacteria Infra-règne Glidobacteria Embranchement Chlorobacteria
Cavalier-Smith, 1992Les chlorobactéries (ou Chlorobacteria) forment un embranchement du règne Bacteria[1]. Il est possible que ce soit l'embranchement bactérien le plus ancien qui existe encore à l'heure actuelle[2] : la racine de l'arbre du vivant pourrait donc se trouver parmi les chlorobactéries ou bien entre les chlorobactéries et le reste du vivant.
Les chlorobactéries tirent leur nom du genre Chloroflexus, qui a lui-même donné son nom à la classe des Chloroflexi. Les chlorobactéries possèdent des métabolismes variés même si le plus typique est la photohétérotrophie anoxygénique des chloroflèxes.
Sommaire
Controverse sur leur structure
Les chlorobactéries sont traditionnellement considérées comme des bactéries Gram négative à structure bimembranée. Il semblerait pourtant que certains membres aient une structure unimembranée[3], ce qui jette le doute sur la monophylie de ce taxon.
Position phylogénétique supposée
DAC phyl. Chlorobacteria (peut-être paraphylétique)
phyl. Hadobacteria
phyl. Cyanobacteria
infrareg. Gracilicutes
phyl. Eurybacteria (paraphylétique)
clade unimembrana subphyl. Endobacteria
subphyl. Actinobacteria (paraphylétique)
clade neomura phyl. Archaebacteria
dom. Eukaryota
Article détaillé : Eubacteria (classification phylogénétique).Classification
‘Candidatus Chlorothrix’♠
- ‘Candidatus Chlorothrix halophila’♠
Classe Anaerolineae
- Anaerolineales
- Anaerolineaceae
- Anaerolinea
- A. thermolimosa
- A. thermophila
- Bellilinea
- Bellilinea caldifistulae
- Leptolinea
- Leptolinea tardivitalis
- Levilinea
- Levilinea saccharolytica
- Longilinea
- Longilinea arvoryzae
- Anaerolinea
- Anaerolineaceae
- Caldilineales
- Caldilineaceae
- Caldilinea
- C. aerophila
- C. tarbellica♠
- Caldilinea
- Caldilineaceae
Classe Chloroflexi
- Kouleothrix♠
- Kouleothrix aurantiaca♠
- Chloroflexales
- Dehalobium♠
- Dehalobium chlorocoercia♠
- Chloroflexaceae
- Chloroflexus
- C. aggregans
- C. aurantiacus
- Chloronema
- Chloronema giganteum
- Heliothrix
- Heliothrix oregonensis
- Roseiflexus
- Roseiflexus castenholzii
- Chloroflexus
- Oscillochloridaceae
- Oscillochloris
- O. chrysea
- O. trichoides
- Oscillochloris
- Dehalobium♠
- Herpetosiphonales
- Herpetosiphonaceae
- Herpetosiphon
- H. aurantiacus
- H. geysericola
- Herpetosiphon
- Herpetosiphonaceae
Classe Dehalococcoidetes
- Dehalococcoides♠
- Dehalococcoides ethenogenes♠
- Dehalogenimonas♠
- Dehalogenimonas lykanthroporepellens ♠
Classe Ktedonobacteria
- Ktedonobacterales
- Ktedonobacteraceae
- Ktedonobacter
- Ktedonobacter racemifer
- Ktedonobacter
- Thermosporotrichaceae
- Thermosporothrix
- Thermosporothrix hazakensis
- Thermosporothrix
- Ktedonobacteraceae
- Thermogemmatisporales
- Thermogemmatisporaceae
- Thermogemmatispora
- T. foliorum♠
- T. onikobensis♠
- Thermogemmatispora
- Thermogemmatisporaceae
Classe Thermomicrobia
- Thermobaculum♠
- Thermobaculum terrenum♠
- Thermomicrobiales
- Thermomicrobiaceae
- Thermomicrobium
- Thermomicrobium roseum
- Thermomicrobium
- Thermomicrobiaceae
- Sphaerobacterales
- Sphaerobacteraceae
- Sphaerobacter
- Sphaerobacter thermophilus
- Sphaerobacter
- Sphaerobacteraceae
Note: ♠ Strain found at the National Center for Biotechnology Information (NCBI) but not recognised by List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) or published by International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (IJSB/IJSEM).
Références
- Thomas Cavalier-Smith, 1998. A revised six-kingdom system of life. Biol. Rev. 73: 203-266.
- Thomas Cavalier-Smith, 2006. Rooting the tree of life by transition analyses. Biol Direct. ; 1: 19. doi: 10.1186/1745-6150-1-19
- DOI:10.1016/j.tim.2010.06.005
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