Chlorobacteria

Chlorobacteria
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 Chloroflexus
Chloroflexus
Classification
Règne Bacteria
Sous-règne Negibacteria
Infra-règne Glidobacteria
Embranchement
Chlorobacteria
Cavalier-Smith, 1992

Les chlorobactéries (ou Chlorobacteria) forment un embranchement du règne Bacteria[1]. Il est possible que ce soit l'embranchement bactérien le plus ancien qui existe encore à l'heure actuelle[2] : la racine de l'arbre du vivant pourrait donc se trouver parmi les chlorobactéries ou bien entre les chlorobactéries et le reste du vivant.

Les chlorobactéries tirent leur nom du genre Chloroflexus, qui a lui-même donné son nom à la classe des Chloroflexi. Les chlorobactéries possèdent des métabolismes variés même si le plus typique est la photohétérotrophie anoxygénique des chloroflèxes.

Sommaire

Controverse sur leur structure

Les chlorobactéries sont traditionnellement considérées comme des bactéries Gram négative à structure bimembranée. Il semblerait pourtant que certains membres aient une structure unimembranée[3], ce qui jette le doute sur la monophylie de ce taxon.

Position phylogénétique supposée

DAC  

 phyl. Chlorobacteria (peut-être paraphylétique)




 phyl. Hadobacteria




 phyl. Cyanobacteria




 infrareg. Gracilicutes




 phyl. Eurybacteria (paraphylétique)


 clade unimembrana 

 subphyl. Endobacteria




 subphyl. Actinobacteria (paraphylétique)


 clade neomura 

 phyl. Archaebacteria



 dom. Eukaryota











Classification

‘Candidatus Chlorothrix’♠

  • ‘Candidatus Chlorothrix halophila’♠

Classe Anaerolineae

  • Anaerolineales
    • Anaerolineaceae
      • Anaerolinea
        • A. thermolimosa
        • A. thermophila
      • Bellilinea
        • Bellilinea caldifistulae
      • Leptolinea
        • Leptolinea tardivitalis
      • Levilinea
        • Levilinea saccharolytica
      • Longilinea
        • Longilinea arvoryzae
  • Caldilineales
    • Caldilineaceae
      • Caldilinea
        • C. aerophila
        • C. tarbellica♠

Classe Chloroflexi

  • Kouleothrix♠
    • Kouleothrix aurantiaca♠
  • Chloroflexales
    • Dehalobium♠
      • Dehalobium chlorocoercia♠
    • Chloroflexaceae
      • Chloroflexus
        • C. aggregans
        • C. aurantiacus
      • Chloronema
        • Chloronema giganteum
      • Heliothrix
        • Heliothrix oregonensis
      • Roseiflexus
        • Roseiflexus castenholzii
    • Oscillochloridaceae
      • Oscillochloris
        • O. chrysea
        • O. trichoides
  • Herpetosiphonales
    • Herpetosiphonaceae
      • Herpetosiphon
        • H. aurantiacus
        • H. geysericola

Classe Dehalococcoidetes

  • Dehalococcoides♠
    • Dehalococcoides ethenogenes♠
  • Dehalogenimonas♠
    • Dehalogenimonas lykanthroporepellens ♠

Classe Ktedonobacteria

  • Ktedonobacterales
    • Ktedonobacteraceae
      • Ktedonobacter
        • Ktedonobacter racemifer
    • Thermosporotrichaceae
      • Thermosporothrix
        • Thermosporothrix hazakensis
  • Thermogemmatisporales
    • Thermogemmatisporaceae
      • Thermogemmatispora
        • T. foliorum♠
        • T. onikobensis♠

Classe Thermomicrobia

  • Thermobaculum♠
    • Thermobaculum terrenum♠
  • Thermomicrobiales
    • Thermomicrobiaceae
      • Thermomicrobium
        • Thermomicrobium roseum
  • Sphaerobacterales
    • Sphaerobacteraceae
      • Sphaerobacter
        • Sphaerobacter thermophilus

Note: ♠ Strain found at the National Center for Biotechnology Information (NCBI) but not recognised by List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) or published by International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (IJSB/IJSEM).

Références

  1. Thomas Cavalier-Smith, 1998. A revised six-kingdom system of life. Biol. Rev. 73: 203-266.
  2. Thomas Cavalier-Smith, 2006. Rooting the tree of life by transition analyses. Biol Direct. ; 1: 19. doi: 10.1186/1745-6150-1-19
  3. DOI:10.1016/j.tim.2010.06.005
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Contenu soumis à la licence CC-BY-SA. Source : Article Chlorobacteria de Wikipédia en français (auteurs)

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