PyMOL
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PyMOL est un logiciel libre de visualisation de structures chimiques en 3D créé par Warren DeLano. Il est principalement utilisé par les étudiants, les professeurs et les chercheurs en chimie et en biologie structurale. Il est développé en Python et est multi-plateformes. Ainsi, il fonctionne sous Windows, Mac OS X, Linux et les systèmes Unix. Ce logiciel est régulièrement utilisé pour produire des images 3D de grande qualité pour la publication scientifique. Selon l'auteur, environ un quart des images 3D de protéines publiées dans la littérature scientifique est réalisé avec PyMOL.
Modes de visualisation
Le logiciel PyMOL supporte de nombreux modes de visualisation :
- Fil de fer
- Boule et bâton
- Remplissage CPK
- Ruban
- Cartoon
- Surface
Fichiers supportés
PyMOL, de par son utilisation dans plusieurs domaines de la chimie et de la biologie, supporte plusieurs types de fichier :
- structure (PDB, CIF, MOL, SDF, MOL2, ...) ;
- carte de densité électronique (x-plor, cube, ...) ;
- séquence biologique (fasta, ...).
Voir aussi
Articles connexes
Liens externes
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2010.
Contenu soumis à la licence CC-BY-SA. Source : Article PyMOL de Wikipédia en français (auteurs)
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