- Liste d'espèces dont le génome est séquencé
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La liste ci-dessous, non exhaustive, présente des espèces dont le génome a été completement séquencé à la date du 12 novembre 2009.
Sommaire
Eubacteria
Article détaillé : Liste d'espèces eubactériennes dont le génome est séquencé.Epsilonproteobacteria
- Campylobacter jejuni[1]. Souche NCTC11168. Génome publié dans EMBL :
- Identifiant (ID): CJ11168
- Numéro d'accès (accession number): AL111168
- Helicobacter hepaticus[2]. Souche ATCC51449. Publié dans GenBank, numéro d'accès: AE017125. Voir aussi www.THE-MWG.com.
- Helicobacter pylori[3]
- Thimicrospira denitrificans
- Wollinella succinogenes[réf. nécessaire]
Deltaproteobacteria
- Anaeromyxobacter dehalogenans
- Bdellovibrio bacteriovorus
- Desulfotalea psychrophila
- Desulfovibrio desulfuricans
- Desulfuvibrio vulgaris
- Desulfuromonas acetoxidans
- Geobacter metallireducen
- Geobacter sulfurreducens
- Pelobacter carbinolicus[réf. nécessaire]
Alphaproteobacteria
- Agrobacterium tumefaciens
- Anaplasma marginale
- Bartonella henselae
- Bradyrhizobium japonicum
- Brucella melitensis
- Brucella suis
- Caulobacter crescentus
- Erlichia canis
- Erlicha ruminantium
- Gluconobacter oxydans
- Jannaschia
- Magnetococcus
- Magnetospirillum magnetotacticum
- Mesorhizobium loti
- Nitrobacter hamburgensis
- Nitrobacter windogradskyi
- Novosphingobium aromaticivorans
- Bartonella quintana
- Paracoccus denitrificans
- Rhodobacter sphaeroides
- Rhodospirillum rubrum
- Rickettsia akari
- Rickettsia conorii
- Rickettsia prowazekii
- Rickettsia sibirica
- Rickettsia typhi
- Silicibacter pomeroyi
- Sinorhizobium meliloti
- Sphingopyxis alaskensis
- Wolbachia pipientis
- Zymomonas mobilis[réf. nécessaire]
Betaproteobacteria
- Azoarcus
- Bordetella bronchiseptica
- Bordetella parapertussis
- Bordetella pertussis
- Burkholderia cenocepacia
- Burkholderia cepacia
- Burkholderia mallei
- Burkholderia pseudomallei
- Burkholderia vietnamiensis
- Burkholderia xenovarans
- Chromobacterium violaceum
- Cupriavidus metallidurans
- Cupriavidus necator
- Dechloromonas aromatica
- Methylobacillus flagellatus
- Neisseria gonorrhoeae
- Neisseria meningitidis
- Nitrosomonas europaea
- Nitrospira multiformis
- Polaromonas
- Ralstonia solanacearum
- Rhodoferax ferrireducens
- Rubrivivax gelatinosus
- Thiobacillus denitrificans[réf. nécessaire]
Archaea
Article détaillé : Liste d'espèces archéeennes dont le génome est séquencé.Eukaryota
Voir la catégorie : Espèce eucaryote dont le génome est séquencé.Plantes
- L'arabette des dames Arabidopsis thaliana, une plante modèle (premier sequençage complet du règne végétal, terminé en 2000)
- Le riz Oryza sativa
- Le blé, Triticum aestivum
- Le maïs, Zea mays
- Le peuplier, Populus trichocarpa
- La tomate Solanum lycopersicum
- La patate Solanum tuberosum
- La vigne, Vitis vinifera L.
- Le sorgho Sorghum bicolor
Invertébrés
- L'oursin, Arbacia punctulata
- Le vers nématode Caenorhabditis elegans
- La drosophile
- L'abeille Apis mellifera
Vertébrés
- Le crapaud xénope, Xenopus laevis
- Le poisson Oryzias latipes
- Le poisson Takifugu rubipres
- Le poisson Danio rerio (Poisson-zèbre)
- Le poisson Tetraodon nigroviridis
- Le poulet, Gallus gallus
Mammifères
- Humains, Homo sapiens ; voir Projet génome humain abouti en 2003
- La souris, Mus musculus
- Le rat, Rattus norvegicus
- Le chimpanzé Pan troglodytes
- Le Macaque rhésus, Macaca mulatta
- Le chat domestique, Felis silvestris
- L'ornithorynque Platypus, Ornithorhynchus anatinus
- La vache, Bos Taurus[4]
- Le cheval, Equus Caballus[5]
Notes et références
- (en) J. Parkhill, B. W. Wren, K. Mungall, J.M. Ketley, C. Churcher, D. Basham, T. Chillingworth, R.M. Davies, T. Feltwell et al., « The genome sequence of the food-borne pathogen Campylobacter jejuni reveals hypervariable sequences », dans Nature, vol. 403, no 6670, 10 février 2000, p. 665-668 (ISSN 0028-0836) [texte intégral, lien DOI]
- (en) Sebastian Suerbaum, Christine Josenhans, Torsten Sterzenbach, Bernd Drescher, Petra Brandt, Monica Bell, Marcus Dröge, Berthold Fartmann, Hans-Peter Fischer et al., « The complete genome sequence of the carcinogenic bacterium Helicobacter hepaticus », dans PNAS, vol. 100, no 13, 24 juin 2003, p. 7901-7906 (ISSN 0027-8424) [texte intégral, lien DOI]
- (en) Jean-F. Tomb, Owen White, Anthony R. Kerlavage, Rebecca A. Clayton, Granger G. Sutton, Robert D. Fleischmann, Karen A. Ketchum, Hans Peter Klenk, Steven Gill et al., « The complete genome sequence of the gastric pathogen Helicobacter pylori », dans Nature, vol. 338, no 6642, 7 août 1997, p. 539-547 (ISSN 0028-0836) [texte intégral, lien DOI]
- http://www.lemonde.fr/planete/article/2009/04/24/la-vache-sans-secret-pour-l-homme_1184995_3244.html
- http://www.sciencedaily.com/releases/2009/11/091105143708.htm (en)
Voir aussi
Bibliographie
- Classification phylogénétique du vivant, G. Lecointre et H. Le Guyader
Articles connexes
- Séquençage de l'ADN
- Projet de séquençage de génome
- Liste d'espèces protéobacteriennes dont le génome est séquencé
- Liste d'espèces eucaryotes dont le génome est séquencé
- Liste d'espèces archéeenes dont le génome est séquencé
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- Campylobacter jejuni[1]. Souche NCTC11168. Génome publié dans EMBL :
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