- Basidiomycota (classification phylogenetique)
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Basidiomycota (classification phylogénétique)
Cette page a pour objet de présenter un arbre phylogénétique des Basidiomycota (ou Basidiomycètes), c'est-à-dire un cladogramme mettant en lumière les relations évolutives complexes (relations groupes ancestraux - groupes descendants) existant entre les différents organismes vivants ou taxa, constituant ce groupe. Du fait de ses méthodes nouvelles basées sur la biologie moléculaire, la phylogénie, science récente à l'origine de la classification phylogénétique du vivant, est en plein essor et propose parfois des résultats en contradiction avec l'ancienne classification, majoritairement basée, elle, sur des critères morphologiques et physiologiques. Aussi, certains points particuliers font parfois encore l'objet de débats au sein de la communauté scientifique. L'objectif, s'il y a lieu, est également de présenter ces derniers ici.
Ce cladogramme présente aussi bien les groupes encore représentés aujourd'hui que ceux qui sont éteints (incluant les groupes fossiles).
À la suite d'un taxon, sa période d'apparition, quand elle est connue, peut être indiquée suivant la légende suivante : (Plé) : Pléistocène ; (Pli) : Pliocène ; (Mio) : Miocène ; (Oli) : Oligocène ; (Éoc) : Éocène ; (Pal) : Paléocène ; (Cré) : Crétacé ; (Jur) : Jurassique ; (Tri) : Trias ; (Per) : Permien ; (Car) : Carbonifère ; (Dév) : Dévonien ; (Sil) : Silurien ; (Ord) : Ordovicien ; (Camb) : Cambrien. De plus, pour plus de précisions si possible, (-) : inférieur ; (~) : moyen ; (+) : supérieur.
Le symbole ▲ renvoie à la partie immédiatement supérieure de l'arbre phylogénétique du vivant. Le signe ► renvoie à la classification phylogénétique du groupe considéré.
Sommaire
Arbre phylogénétique
▲ └─o Basidiomycota ├─? Wallemiomycetes ├─o Entorrhizomycetes └─o ├─o Pucciniomycotina │ ├─o Cryptomycocolacomycetes │ ├─o Mixiomycetes │ ├─o Cystobasidiomycetes │ ├─o Classiculomycetes │ ├─o Microbotryomycetes │ ├─o Agaricostilbomycetes │ ├─o Atractiellomycetes │ └─o Pucciniomycetes └─o Orthomycotina ├─o Ustilaginomycotina │ ├─o Ustilaginomycetes │ └─o Exobasidiomycetes └─o Agaricomycotina ├─o Tremellomycetes └─o Hymenomycetidae ├─o Dacrymycetes └─o Agaricomycetes
Arbre développé▲ └─o Basidiomycota ├─? Wallemiomycetes ├─o Entorrhizomycetes └─o ├─o Pucciniomycotina ou Urediniomycetes │ ├─o Cryptomycocolacomycetes ou Cryptomycocolacales │ ├─o Mixiomycetes ou Mixiales │ ├─o Cystobasidiomycetes │ │ ├─o Cystobasidiales │ │ ├─o Naohideales │ │ └─o Erythrobasidiales │ ├─o Classiculomycetes ou Classiculales │ ├─o Microbotryomycetes │ │ ├─? Camptobasidiaceae │ │ ├─o Heterogastridiales │ │ ├─o Leucosporidiales │ │ ├─o Sporidiobolales │ │ └─o Microbotryales │ │ ├─o Microbotryaceae │ │ └─o Ustilentylomataceae │ ├─o Agaricostilbomycetes │ │ ├─o Spiculogloeales │ │ └─o Agaricostilbales │ │ ├─o Agaricostilbaceae │ │ └─o Chionosphaeraceae │ ├─o Atractiellomycetes ou Atractiellales │ │ ├─o Hoehnelomycetaceae │ │ ├─o Phleogenaceae │ │ └─o Saccoblastiaceae │ └─o Pucciniomycetes │ ├─o Helicobasidiales │ ├─o Septobasidiales │ ├─o Pachnocybales │ └─o │ ├─o Platygloeales │ │ ├─o Eocronartiaceae │ │ └─o Platygloeaceae │ └─o Uredinales ou Pucciniales │ ├─o Chaconiaceae │ ├─o Coleosporiaceae │ ├─o Cronartiaceae │ ├─o Melampsoraceae │ ├─o Phakopsoraceae │ ├─o Phragmidiaceae │ ├─o Pileolariaceae │ ├─o Pucciniaceae │ ├─o Pucciniastraceae │ ├─o Pucciniosiraceae │ ├─o Sphaerophragmiaceae │ └─o Uropyxidaceae └─o Orthomycotina ├─o Ustilaginomycotina │ ├─? Malasseziales │ ├─o Ustilaginomycetes │ │ ├─o Urocystales │ │ │ ├─o Doassansiopsaceae │ │ │ ├─o Melanotaeniaceae │ │ │ └─o Urocystaceae │ │ └─o Ustilaginales │ │ ├─o Anthracoideaceae │ │ ├─o Cintractiaceae │ │ ├─o Glomosporiaceae │ │ └─o Ustilaginaceae │ └─o Exobasidiomycetes │ ├─o Entylomatales │ ├─o Tilletiales │ ├─o Microstromatales │ │ ├─o Microstromataceae │ │ └─o Volvocisporiaceae │ ├─o Doassansiales │ │ ├─o Doassansiaceae │ │ ├─o Melaniellaceae │ │ └─o Rhamphosporaceae │ ├─o Georgefischeriales │ │ ├─o Eballistraceae │ │ ├─o Georgefischeriaceae │ │ ├─o Gjaerumiaceae │ │ └─o Tilletiariaceae │ └─o Exobasidiales │ ├─o Brachybasidiaceae │ ├─o Cryptobasidiaceae │ ├─o Exobasidiaceae │ └─o Graphiolaceae └─o Agaricomycotina ou Hymenomycetes ├─o Tremellomycetes │ ├─o Cystofilobasidiales │ └─o │ ├─o Filobasidiales │ └─o Tremellales │ ├─o Trichosporonales │ ├─o Christianseniales │ └─o Tremellales s.s. │ ├─o Aporpiaceae │ ├─o Sirobasidiaceae │ └─o Tremellaceae └─o Hymenomycetidae ├─o Dacrymycetes ou Dacrymycetales │ ├─o Cerinomycetaceae │ └─o Dacrymycetaceae └─o Agaricomycetes ├─o groupe Basidiodendron └─o ├─o Auriculariales │ ├─o Auriculariaceae │ ├─o Exidiaceae │ └─o Hyaloriaceae └─o ├─o Sebacinales └─o ├─o Cantharellales │ ├─o Albatrellaceae │ ├─o Cantharellaceae │ ├─o Clavulinaceae │ ├─o Hydnaceae │ └─o Tulasnellaceae ├─o Hymenochaetales ├─o Phallomycetidae │ ├─o Geastrales │ ├─o Gomphales │ ├─o Hysterangiales │ └─o Phallales │ ├─o Clathraceae │ ├─o Phallaceae │ └─o Sphaerobolaceae └─o ├─o │ ├─o Gloeophyllales │ └─o Corticiales ├─o │ ├─o Trechisporales │ └─o Polyporales │ ├─o Albatrellaceae │ ├─o Boreostereaceae │ ├─o Cystostereaceae │ ├─o Epitheliaceae │ ├─o Fomitopsidaceae │ ├─o Ganodermataceae │ ├─o Grammotheleaceae │ ├─o Hapalopilaceae │ ├─o Hyphodermataceae │ ├─o Meripilaceae │ ├─o Meruliaceae │ ├─o Phanerochaetaceae │ ├─o Podoscyphaceae │ ├─o Polyporaceae │ ├─o Sistotremataceae │ ├─o Sparassidaceae │ ├─o Steccherinaceae │ ├─o Tubulicrinaceae │ └─o Xenasmataceae ├─o Thelephorales │ ├─o Bankeraceae │ └─o Thelephoraceae ├─o Russulales │ ├─o Auriscalpiaceae │ ├─o Bondarzewiaceae │ ├─o Echinodontiaceae │ ├─o Gloeocystidiellaceae │ ├─o Hericiaceae │ ├─o Hybogasteraceae │ ├─o Lachnocladiaceae │ ├─o Peniophoraceae │ ├─o Stephanosporaceae │ ├─o Stereaceae │ └─o Russulaceae └─o Agaricomycetidae ├─o Jaapia └─o ├─o Atheliales └─o ├─o Boletales │ ├─o Tapinellaceae │ ├─o Serpulaceae │ ├─o Coniophoraceae │ ├─o │ │ ├─o Hygrophoropsidaceae │ │ └─o Suillineae │ │ ├─o Gomphidiaceae │ │ ├─o Rhizopogonaceae │ │ ├─o Truncocolumellaceae │ │ └─o Suillaceae │ └─o │ ├─o │ │ ├─o Boletineae │ │ │ ├─o Boletaceae │ │ │ └─o Leucogastraceae │ │ └─o Paxillineae │ │ ├─o Austropaxillaceae │ │ ├─o Gyrodontaceae │ │ └─o Paxillaceae │ └─o Sclerodermatineae │ ├─o Boletinellaceae │ └─o │ ├─o Calostomataceae │ ├─o Diplocystaceae │ ├─o Gyroporaceae │ ├─o Pisolithaceae │ └─o Sclerodermataceae └─o Agaricales ├─o groupe plicaturopsidoïde │ ├─o │ │ ├─o Camarophyllopsis │ │ └─o Clavariaceae │ └─o │ ├─o Plicaturopsis │ └─o │ ├─o Podoserpula │ └─o Sclerotium └─o ├─o groupe hygrophoroïde │ ├─o Hygrophoraceae │ └─o │ ├─o Sarcomyxa │ ├─o Xeromphalina │ └─o │ ├─o Pterulaceae │ └─o Typhulaceae ├─o groupe plutéoïde │ ├─o Macrocystidiaceae │ └─o │ ├─o │ │ ├─o Limnoperdonaceae │ │ └─o Pluteaceae │ └─o │ ├─o Amanitaceae │ └─o Pleurotaceae ├─o groupe marasmioïde │ ├─o │ │ ├─o Physalacriaceae │ │ └─o │ │ ├─o Lachnellaceae │ │ └─o Schizophyllaceae │ └─o │ ├─o │ │ ├─o Marasmiaceae │ │ └─o Omphalotaceae │ └─o │ ├─o │ │ ├─o Pleurotopsis │ │ └─o Hemimycena │ └─o │ ├─o Cyphellaceae │ └─o groupe hydropoïde └─o ├─o groupe tricholomatoïde │ ├─? Pseudoclitocybe │ ├─o Infundibulicybe │ └─o │ ├─o Mycenaceae │ └─o │ ├─o groupe Catathelasma │ └─o │ ├─o Neohygrophorus │ └─o │ ├─o Dendrocollybia │ └─o │ ├─o Tricholomataceae │ │ ├─o Clitocybeae │ │ └─o Tricholomateae │ └─o │ ├─o Entolomataceae │ └─o Lyophyllaceae └─o groupe agaricoïde ├─o │ ├─o Agaricaceae │ └─o │ ├─o Cystodermateae │ └─o Nidulariaceae └─o ├─o │ ├─o Hydnangiaceae │ └─o Psathyrellaceae └─o ├─o │ ├─o Bolbitiaceae │ └─o Cortinariaceae └─o ├─o Gymnopileae └─o ├─o │ ├─o Hymenogasteraceae │ └─o Strophariaceae └─o ├─o Panaeoleae ├─o Tubarieae └─o ├─o Crepidotaceae └─o Inocybaceae
Débat scientifique relatif à la phylogénie des Basidiomycota
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Sources bibliographiques de référence
- D. S. Hibbett et al. (2007) « A higher-level phylogenetic classification of the Fungi », Mycol. Res. 111, pp. 509-547
- Sina M. Adl et al. (2005) « The New Higher Level Classification of Eukaryotes », J. Eukaryot. Microbiol., 52 (5), p. 399–451
- Thomas Cavalier-Smith (1998) « A revised six-kingdom system of life », Biological reviews 73, p. 203-266
Autres sources bibliographiques
Sources internet
Liens internes
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- Arbre phylogénétique
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- Répertoire général des ressources en mycologie
Astraeus hygrometricus (Boletales, Astraeaceae)
Clavulina cristata (Cantharellales, Clavulinaceae)
Sparassis crispa (Polyporales, Sparassidaceae)
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