- Ascomycota (classification phylogénétique)
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Cette page a pour objet de présenter un arbre phylogénétique des Ascomycota (Ascomycètes), c'est-à-dire un cladogramme mettant en lumière les relations de parenté existant entre leurs différents groupes (ou taxa), telles que les dernières analyses reconnues les proposent. Ce n'est qu'une possibilité, et les principaux débats qui subsistent au sein de la communauté scientifique sont brièvement présentés ci-dessous, avant la bibliographie.
Sommaire
Arbre phylogénétique
À la suite d'un taxon, sa période d'apparition, quand elle est connue, peut être indiquée suivant la légende suivante : (Plé) : Pléistocène ; (Pli) : Pliocène ; (Mio) : Miocène ; (Oli) : Oligocène ; (Éoc) : Éocène ; (Pal) : Paléocène ; (Cré) : Crétacé ; (Jur) : Jurassique ; (Tri) : Trias ; (Per) : Permien ; (Car) : Carbonifère ; (Dév) : Dévonien ; (Sil) : Silurien ; (Ord) : Ordovicien ; (Camb) : Cambrien. De plus, pour plus de précisions si possible, (-) : inférieur ; (~) : moyen ; (+) : supérieur.
Le symbole ▲ renvoie à la partie immédiatement supérieure de l'arbre phylogénétique du vivant. Le signe ► renvoie à la classification phylogénétique du groupe considéré.
Tout nœud de l'arbre portant plus de deux branches montre une indétermination de la phylogénie interne du groupe considéré. Le symbole ... indique que le nœud qu'il désigne n'a pas (encore) reçu de nom reconnu par la communauté scientifique.
▲ └─o Ascomycota ├─o Taphrinomycotina │ ├─o Neolectomycetes │ ├─o Pneumocystidomycetes │ ├─o Schizosaccharomycetes │ └─o Taphrinomycetes └─o ├─o Saccharomycotina └─o Pezizomycotina ├─o │ ├─o Orbiliomycetes │ └─o Pezizomycetes └─o Leotiomyceta ├─o │ ├─o Arthoniomycetes │ └─o Dothideomycetes ├─o Lichinomycetes ├─o │ ├─o Leotiomycetes │ └─o Sordariomycetes ├─o Laboulbeniomycetes └─o ├─o Eurotiomycetes └─o Lecanoromycetes
Arbre développé▲ └─o Ascomycota ├─o Taphrinomycotina │ ├─o Neolectomycetes │ ├─o Pneumocystidomycetes │ ├─o Schizosaccharomycetes │ └─o Taphrinomycetes │ ├─o Protomycetaceae │ └─o Taphrinaceae └─o ├─o Saccharomycotina ou Saccharomycetes │ ├─o groupe Trichomonascacus │ ├─o groupe Zygozyma │ ├─o │ │ ├─o groupe Pichia │ │ ├─o groupe Dipodascus │ │ └─o groupe Metschnikowia │ └─o │ ├─o groupe Candida albicans │ ├─o groupe Candida oligophaga │ ├─o groupe Scheffersomyces │ ├─o groupe Saccharomycopsis │ ├─o groupe Wickerhamomyces │ ├─o groupe Candida ovalis │ └─o groupe Saccharomyces └─o Pezizomycotina ├─? Amorphothecaceae ├─? Aphanopsidaceae ├─? Aspidotheliaceae ├─? Baemycetaceae ├─? Batistiaceae ├─? Coccotremataceae ├─? Coniocybaceae ├─? Diprorothecaceae ├─? Eoterfeziaceae ├─? Epigloeaceae ├─? Hispidicarpomycetaceae ├─? Koralionastetaceae ├─? Lautosporaceae ├─? Mastodiaceae ├─? Microcaliciaceae ├─? Mucomassariaceae ├─? Phyllobatheliaceae ├─? Pleurotremataceae ├─? Protothelenellaceae ├─? Saccardiaceae ├─? Seuratiaceae ├─? Testudinaceae ├─? Thelenellaceae ├─? Thelocarpaceae ├─? Xanthopyreniaceae ├─? Lahmiales ├─? Medeolariales ├─? Triblidiales ├─o │ ├─o Orbiliomycetes │ └─o Pezizomycetes │ ├─o Ascobolaceae │ ├─o Ascodesmidaceae │ ├─o Caloscyphaceae │ ├─o Carbomycetaceae │ ├─o Discinaceae │ ├─o Glaziellaceae │ ├─o Helvellaceae │ ├─o Karstenellaceae │ ├─o Morchellaceae │ ├─o Pezizaceae │ ├─o Pyronemataceae │ ├─o Rhizinaceae │ ├─o Sarcoscyphaceae │ ├─o Sarcosomataceae │ └─o Tuberaceae └─o Leotiomyceta ├─o │ ├─o Arthoniomycetes ou Arthoniales │ │ ├─o Arthoniaceae │ │ ├─o Chrysotrichaceae │ │ ├─o Melaspileaceae │ │ └─o Roccellaceae │ └─o Dothideomycetes │ ├─? Acrospermaceae │ ├─? Argynnaceae │ ├─? Arthropyreniaceae │ ├─? Ascoporiaceae │ ├─? Asterinaceae │ ├─? Aulographaceae │ ├─? Coccoideaceae │ ├─? Cookellaceae │ ├─? Corynesporascaceae │ ├─? Cucurbitariaceae │ ├─? Dacampiaceae │ ├─? Diademaceae │ ├─? Didymosphaeriaceae │ ├─? Englerulaceae │ ├─? Eremomycetaceae │ ├─? Euantennariaceae │ ├─? Fenestellaceae │ ├─? Hypsostromataceae │ ├─? Leptopeltidaceae │ ├─? Lichenotheliaceae │ ├─? Meliolinaceae │ ├─? Mesnieraceae │ ├─? Micropeltidaceae │ ├─? Microtheliopsidaceae │ ├─? Microthyriaceae │ ├─? Moriolaceae │ ├─? Mycoporaceae │ ├─? Naetrocymbaceae │ ├─? Parmulariaceae │ ├─? Parodiellaceae │ ├─? Parodiopsidaceae │ ├─? Piedraiaceae │ ├─? Planistromellaceae │ ├─? Polystomellaceae │ ├─? Protoscyphaceae │ ├─? Pseudoperisporiaceae │ ├─? Pyrenotrichaceae │ ├─? Schizothyriaceae │ ├─? Vizellaceae │ ├─? Zopfiaceae │ ├─? Tubeufiaceae │ ├─? Trypetheliaceae │ ├─? Botryosphaeriales │ ├─? Hysteriales │ ├─? Jahnulales │ ├─? Patellariales │ ├─o Pleosporomycetidae │ │ ├─o Mytilinidiaceae │ │ └─o Pleosporales │ │ ├─o Delitschiaceae │ │ ├─o Leptosphaeriaceae │ │ ├─o Phaeosphaeriaceae │ │ ├─o Pleosporaceae │ │ └─o Sporormiaceae │ └─o Dothideomycetidae │ ├─o Dothideales │ │ ├─o Dothideaceae │ │ └─o Dothioraceae │ ├─o Myriangiales │ │ ├─o Elsinoaceae │ │ └─o Myriangiaceae │ └─o Capnodiales │ ├─o Davidiellaceae │ ├─o Capnodiaceae │ ├─o Coccodiniaceae │ └─o Mycosphaerellaceae ├─o │ ├─? Geoglossaceae │ └─o Lichinomycetes │ ├─o Gloeoheppiaceae │ ├─o Heppiaceae │ ├─o Lichinaceae │ └─o Peltulaceae ├─o │ ├─o Leotiomycetes │ │ ├─o Myxotrichaceae │ │ ├─o Pseudeurotiaceae │ │ ├─o Thelebolales │ │ ├─o Cyttariales │ │ ├─o Erysiphales │ │ ├─o Rhytismatales │ │ │ ├─o Ascodichaenaceae │ │ │ ├─o Cryptomycetaceae │ │ │ ├─o Cudoniaceae │ │ │ └─o Rhytismataceae │ │ └─o Helotiales │ │ ├─? Ascocorticiaceae │ │ ├─o Bulgariaceae │ │ ├─o Dermateaceae │ │ ├─o Helotiaceae │ │ ├─o Hemiphacidiaceae │ │ ├─o Hyaloscyphaceae │ │ ├─o Leotiaceae │ │ ├─o Loramycetaceae │ │ ├─o Phacidiaceae │ │ ├─o Rutstroemiaceae │ │ ├─o Sclerotiniaceae │ │ └─o Vibrisseaceae │ └─o Sordariomycetes │ ├─? Apiosporaceae │ ├─? Catabotrydaceae │ ├─? Magnaporthaceae │ ├─? Obryzaceae │ ├─? Thyridiaceae │ ├─? Trichosphaeriales │ ├─? Calosphaeriales │ │ ├─o Calosphaeriaceae │ │ └─o Pleurostomataceae │ ├─? Lulworthiales │ │ ├─o Lulworthiaceae │ │ └─o Spathulosporaceae │ ├─? Meliolales │ │ ├─o Armatellaceae │ │ └─o Meliolaceae │ ├─? Phyllachorales │ │ ├─o Phaeochoraceae │ │ └─o Phyllacoraceae │ ├─o Xylariomycetidae ou Xylariales │ │ ├─o Amphisphaeriaceae │ │ ├─o Clypeosphaeriaceae │ │ ├─o Diatrypaceae │ │ ├─o Graphostromataceae │ │ ├─o Hyponectriaceae │ │ └─o Xylariaceae │ ├─o Hypocreomycetidae │ │ ├─o Halosphaeriales │ │ ├─o Microascales │ │ │ ├─o Chadefaudiellaceae │ │ │ └─o Microascaceae │ │ ├─o Coronophorales │ │ │ ├─o Bertiaceae │ │ │ ├─o Chaetosphaerellaceae │ │ │ ├─o Nitschkiaceae │ │ │ └─o Scotechiniaceae │ │ └─o Hypocreales │ │ ├─o Bionectriaceae │ │ ├─o Ceratostomataceae │ │ ├─o Clavicipitaceae │ │ ├─o Hypocreaceae │ │ ├─o Nectriaceae │ │ └─o Niessliaceae │ └─o Sordariomycetidae │ ├─? Annulatascaceae │ ├─? Cephalothecaceae │ ├─? Helminthosphaeriaceae │ ├─? Papulosaceae │ ├─o Boliniales │ ├─o Chaetosphaeriales │ ├─o Coniochaetales │ ├─o 'Ophistomatales │ │ ├─o Kathistaceae │ │ └─o Ophiostomataceae │ ├─o Sordariales │ │ ├─o Chaetomiaceae │ │ ├─o Lasiosphaeriaceae │ │ └─o Sordariaceae │ └─o Diaporthales │ ├─o Diaporthaceae │ ├─o Gnomoniaceae │ ├─o Melanconidaceae │ ├─o Togniniaceae │ ├─o Valsaceae │ └─o Vialaeaceae ├─o Laboulbeniomycetes │ ├─o Pixidiophorales │ └─o Laboulbeniales │ ├─o Ceratomycetaceae │ ├─o Euceratomycetaceae │ ├─o Herpomycetaceae │ └─o Laboulbeniaceae └─o ├─o Eurotiomycetes │ ├─o Mycocaliciomycetidae ou Mycocaliciales │ │ ├─o Mycocaliciaceae │ │ └─o Sphinctrinaceae │ └─o │ ├─o Chaetothyriomycetidae │ │ ├─? Rhynchostomataceae │ │ ├─? Strigulaceae │ │ ├─o Pyrenulales │ │ │ ├─o Massariaceae │ │ │ ├─o Monoblastiaceae │ │ │ ├─o Pyrenulaceae │ │ │ └─o Requienellaceae │ │ └─o │ │ ├─o Chaetothyriales │ │ │ ├─o Chaetothyriaceae │ │ │ └─o Herpotrichiellaceae │ │ └─o Verrucariales │ │ ├─o Adelococcaceae │ │ └─o Verrucariaceae │ └─o Eurotiomycetidae │ ├─o Coryneliales │ └─o │ ├─o Ascosphaerales │ │ ├─o Ascosphaeraceae │ │ └─o Eremascaceae │ ├─o Eurotiales │ │ ├─o Elaphomycetaceae │ │ ├─o Monascaceae │ │ └─o Trichocomaceae │ └─o │ ├─o Arachnomycetales │ └─o Onygenales │ ├─o Ajellomycetaceae │ ├─o Arthrodermataceae │ ├─o Gymnoascaceae │ └─o Onygenaceae └─o Lecanoromycetes ├─o Acarosporomycetidae ou Acarosporales │ ├─o Acarosporaceae │ └─o Hymeneliaceae └─o ├─o │ ├─o Umbilicariaceae │ └─o │ ├─o Agyriales │ │ ├─o Agyriaceae │ │ ├─o Elixiaceae │ │ └─o Anamylopsoraceae │ └─o Ostropomycetidae │ ├─o Pertusariales │ │ ├─? Megasporaceae │ │ ├─o Icmadophilaceae │ │ └─o │ │ ├─o Coccotremataceae │ │ └─o Pertusariaceae │ └─o │ ├─o Baeomycetales │ └─o Ostropales │ ├─? Asterothyriaceae │ ├─? Graphidaceae │ ├─? Odontotremataceae │ ├─? Phaneromycetaceae │ ├─? Solorinellaceae │ ├─o Trapeliopsis │ └─o │ ├─o Placopsis │ └─o │ ├─o Stictidaceae │ └─o Gyalectales │ ├─o Coenogoniaceae │ └─o │ ├─o Gyalectaceae │ └─o Thelotremataceae ├─? Trichotheliales │ ├─o Myeloconidaceae │ └─o Porinaceae └─o Lecanoromycetidae ├─? Anziaceae ├─? 'Arctomiacea ├─? Arthrorhaphidaceae ├─? Bacidiaceae ├─? Biatorellaceae ├─? Brigantiaeaceae ├─? Catillariaceae ├─? Cetradoniaceae ├─? Cladoniaceae ├─? Candelariaceae ├─? Crocyniaceae ├─? Dactylosporaceae ├─? Ectolechiaceae ├─? Gypsoplacaceae ├─? Haematommataceae ├─? Lecanoraceae ├─? Lecideaceae ├─? Loxosporaceae ├─? Megalariaceae ├─? Megalosporaceae ├─? Micareaceae ├─? Miltideaceae ├─? Mycoblastaceae ├─? Ophioparmaceae ├─? Pachyascaceae ├─? Parmeliaceae ├─? Phlyctidaceae ├─? Pilocarpaceae ├─? Psoraceae ├─? Ramalinaceae ├─? Vezdaeaceae ├─o Porpidiaceae └─o ├─o │ ├─o Sphaerophoraceae │ └─o Stereocaulaceae └─o ├─o │ ├─o Rhizocarpaceae │ └─o │ ├─o Caliciales │ │ ├─o Caliciaceae │ │ └─o Physciaceae │ └─o Teloschistales │ ├─o Letrouitiaceae │ ├─o Fuscideaceae │ └─o Teloschistaceae └─o Peltigerales ├─? Coccocarpiaceae ├─o Collematineae │ ├─o Collemataceae │ ├─o Placynthiaceae │ └─o Pannariaceae └─o Peltigerineae ├─o Nephromataceae └─o ├─o Lobariaceae └─o Peltigeraceae
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Penicillium sp. (Euascomycetes, Eurotiales, Trichomaceae)
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Sarcoscypha coccinea (Ascomycetes, Sarcoscyphaceae)
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Nectria cinnabarina (Ascomycetes)
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Xylaria sp. (Ascomycetes, Sphaeriales)
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Camarops polysperma (Ascomycetes, Boliniaceae)
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Hypoxylon fragiforme (Ascomycetes, Xylariales, Xylariaceae)
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Lichen foliacé (Evernia prunastri, Lecanoromycetes, Lecanorales, Parmeliaceae)
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Xanthoria parietina (Lecanoromycetes, Lecanorales, Parmeliaceae)
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Uncinula tulasnei (Pezizomycotina, Erysiphales, Erysiphaceae)
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Trichoderma fertile (Ascomycetes, Hypocreales, Hypocreaceae)
Débat scientifique relatif à la phylogénie des Ascomycota
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Sources bibliographiques de référence
Autres sources bibliographiques
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