- Ascomycota (classification phylogenetique)
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Ascomycota (classification phylogénétique)
Cette page a pour objet de présenter un arbre phylogénétique des Ascomycota (ou Ascomycètes), c'est-à-dire un cladogramme mettant en lumière les relations évolutives complexes (relations groupes ancestraux - groupes descendants) existant entre les différents organismes vivants ou taxa, constituant ce groupe. Du fait de ses méthodes nouvelles basées sur la biologie moléculaire, la phylogénie, science récente à l'origine de la classification phylogénétique du vivant, est en plein essor et propose parfois des résultats en contradiction avec l'ancienne classification, majoritairement basée, elle, sur des critères morphologiques et physiologiques. Aussi, certains points particuliers font parfois encore l'objet de débats au sein de la communauté scientifique. L'objectif, s'il y a lieu, est également de présenter ces derniers ici.
Ce cladogramme présente aussi bien les groupes encore représentés aujourd'hui que ceux qui sont éteints (incluant les groupes fossiles).
À la suite d'un taxon, sa période d'apparition, quand elle est connue, peut être indiquée suivant la légende suivante : (Plé) : Pléistocène ; (Pli) : Pliocène ; (Mio) : Miocène ; (Oli) : Oligocène ; (Éoc) : Éocène ; (Pal) : Paléocène ; (Cré) : Crétacé ; (Jur) : Jurassique ; (Tri) : Trias ; (Per) : Permien ; (Car) : Carbonifère ; (Dév) : Dévonien ; (Sil) : Silurien ; (Ord) : Ordovicien ; (Camb) : Cambrien. De plus, pour plus de précisions si possible, (-) : inférieur ; (~) : moyen ; (+) : supérieur.
Le symbole ▲ renvoie à la partie immédiatement supérieure de l'arbre phylogénétique du vivant. Le signe ► renvoie à la classification phylogénétique du groupe considéré.
Sommaire
Arbre phylogénétique
▲ └─o Ascomycota ├─o Taphrinomycotina │ ├─o Neolectomycetes │ ├─o Pneumocystidomycetes │ ├─o Schizosaccharomycetes │ └─o Taphrinomycetes └─o ├─o Saccharomycotina └─o Pezizomycotina ├─o │ ├─o Orbiliomycetes │ └─o Pezizomycetes └─o Leotiomyceta ├─o │ ├─o Arthoniomycetes │ └─o Dothideomycetes ├─o Lichinomycetes ├─o │ ├─o Leotiomycetes │ └─o Sordariomycetes ├─o Laboulbeniomycetes └─o ├─o Eurotiomycetes └─o Lecanoromycetes
Arbre développé▲ └─o Ascomycota ├─o Taphrinomycotina │ ├─o Neolectomycetes │ ├─o Pneumocystidomycetes │ ├─o Schizosaccharomycetes │ └─o Taphrinomycetes │ ├─o Protomycetaceae │ └─o Taphrinaceae └─o ├─o Saccharomycotina ou Saccharomycetes │ ├─o groupe Trichomonascacus │ ├─o groupe Zygozyma │ ├─o │ │ ├─o groupe Pichia │ │ ├─o groupe Dipodascus │ │ └─o groupe Metschnikowia │ └─o │ ├─o groupe Candida albicans │ ├─o groupe Candida oligophaga │ ├─o groupe Scheffersomyces │ ├─o groupe Saccharomycopsis │ ├─o groupe Wickerhamomyces │ ├─o groupe Candida ovalis │ └─o groupe Saccharomyces └─o Pezizomycotina ├─? Amorphothecaceae ├─? Aphanopsidaceae ├─? Aspidotheliaceae ├─? Baemycetaceae ├─? Batistiaceae ├─? Coccotremataceae ├─? Coniocybaceae ├─? Diprorothecaceae ├─? Eoterfeziaceae ├─? Epigloeaceae ├─? Hispidicarpomycetaceae ├─? Koralionastetaceae ├─? Lautosporaceae ├─? Mastodiaceae ├─? Microcaliciaceae ├─? Mucomassariaceae ├─? Phyllobatheliaceae ├─? Pleurotremataceae ├─? Protothelenellaceae ├─? Saccardiaceae ├─? Seuratiaceae ├─? Testudinaceae ├─? Thelenellaceae ├─? Thelocarpaceae ├─? Xanthopyreniaceae ├─? Lahmiales ├─? Medeolariales ├─? Triblidiales ├─o │ ├─o Orbiliomycetes │ └─o Pezizomycetes │ ├─o Ascobolaceae │ ├─o Ascodesmidaceae │ ├─o Caloscyphaceae │ ├─o Carbomycetaceae │ ├─o Discinaceae │ ├─o Glaziellaceae │ ├─o Helvellaceae │ ├─o Karstenellaceae │ ├─o Morchellaceae │ ├─o Pezizaceae │ ├─o Pyronemataceae │ ├─o Rhizinaceae │ ├─o Sarcoscyphaceae │ ├─o Sarcosomataceae │ └─o Tuberaceae └─o Leotiomyceta ├─o │ ├─o Arthoniomycetes ou Arthoniales │ │ ├─o Arthoniaceae │ │ ├─o Chrysotrichaceae │ │ ├─o Melaspileaceae │ │ └─o Roccellaceae │ └─o Dothideomycetes │ ├─? Acrospermaceae │ ├─? Argynnaceae │ ├─? Arthropyreniaceae │ ├─? Ascoporiaceae │ ├─? Asterinaceae │ ├─? Aulographaceae │ ├─? Coccoideaceae │ ├─? Cookellaceae │ ├─? Corynesporascaceae │ ├─? Cucurbitariaceae │ ├─? Dacampiaceae │ ├─? Diademaceae │ ├─? Didymosphaeriaceae │ ├─? Englerulaceae │ ├─? Eremomycetaceae │ ├─? Euantennariaceae │ ├─? Fenestellaceae │ ├─? Hypsostromataceae │ ├─? Leptopeltidaceae │ ├─? Lichenotheliaceae │ ├─? Meliolinaceae │ ├─? Mesnieraceae │ ├─? Micropeltidaceae │ ├─? Microtheliopsidaceae │ ├─? Microthyriaceae │ ├─? Moriolaceae │ ├─? Mycoporaceae │ ├─? Naetrocymbaceae │ ├─? Parmulariaceae │ ├─? Parodiellaceae │ ├─? Parodiopsidaceae │ ├─? Piedraiaceae │ ├─? Planistromellaceae │ ├─? Polystomellaceae │ ├─? Protoscyphaceae │ ├─? Pseudoperisporiaceae │ ├─? Pyrenotrichaceae │ ├─? Schizothyriaceae │ ├─? Vizellaceae │ ├─? Zopfiaceae │ ├─? Tubeufiaceae │ ├─? Trypetheliaceae │ ├─? Botryosphaeriales │ ├─? Hysteriales │ ├─? Jahnulales │ ├─? Patellariales │ ├─o Pleosporomycetidae │ │ ├─o Mytilinidiaceae │ │ └─o Pleosporales │ │ ├─o Delitschiaceae │ │ ├─o Leptosphaeriaceae │ │ ├─o Phaeosphaeriaceae │ │ ├─o Pleosporaceae │ │ └─o Sporormiaceae │ └─o Dothideomycetidae │ ├─o Dothideales │ │ ├─o Dothideaceae │ │ └─o Dothioraceae │ ├─o Myriangiales │ │ ├─o Elsinoaceae │ │ └─o Myriangiaceae │ └─o Capnodiales │ ├─o Davidiellaceae │ ├─o Capnodiaceae │ ├─o Coccodiniaceae │ └─o Mycosphaerellaceae ├─o │ ├─? Geoglossaceae │ └─o Lichinomycetes │ ├─o Gloeoheppiaceae │ ├─o Heppiaceae │ ├─o Lichinaceae │ └─o Peltulaceae ├─o │ ├─o Leotiomycetes │ │ ├─o Myxotrichaceae │ │ ├─o Pseudeurotiaceae │ │ ├─o Thelebolales │ │ ├─o Cyttariales │ │ ├─o Erysiphales │ │ ├─o Rhytismatales │ │ │ ├─o Ascodichaenaceae │ │ │ ├─o Cryptomycetaceae │ │ │ ├─o Cudoniaceae │ │ │ └─o Rhytismataceae │ │ └─o Helotiales │ │ ├─? Ascocorticiaceae │ │ ├─o Bulgariaceae │ │ ├─o Dermateaceae │ │ ├─o Helotiaceae │ │ ├─o Hemiphacidiaceae │ │ ├─o Hyaloscyphaceae │ │ ├─o Leotiaceae │ │ ├─o Loramycetaceae │ │ ├─o Phacidiaceae │ │ ├─o Rutstroemiaceae │ │ ├─o Sclerotiniaceae │ │ └─o Vibrisseaceae │ └─o Sordariomycetes │ ├─? Apiosporaceae │ ├─? Catabotrydaceae │ ├─? Magnaporthaceae │ ├─? Obryzaceae │ ├─? Thyridiaceae │ ├─? Trichosphaeriales │ ├─? Calosphaeriales │ │ ├─o Calosphaeriaceae │ │ └─o Pleurostomataceae │ ├─? Lulworthiales │ │ ├─o Lulworthiaceae │ │ └─o Spathulosporaceae │ ├─? Meliolales │ │ ├─o Armatellaceae │ │ └─o Meliolaceae │ ├─? Phyllachorales │ │ ├─o Phaeochoraceae │ │ └─o Phyllacoraceae │ ├─o Xylariomycetidae ou Xylariales │ │ ├─o Amphisphaeriaceae │ │ ├─o Clypeosphaeriaceae │ │ ├─o Diatrypaceae │ │ ├─o Graphostromataceae │ │ ├─o Hyponectriaceae │ │ └─o Xylariaceae │ ├─o Hypocreomycetidae │ │ ├─o Halosphaeriales │ │ ├─o Microascales │ │ │ ├─o Chadefaudiellaceae │ │ │ └─o Microascaceae │ │ ├─o Coronophorales │ │ │ ├─o Bertiaceae │ │ │ ├─o Chaetosphaerellaceae │ │ │ ├─o Nitschkiaceae │ │ │ └─o Scotechiniaceae │ │ └─o Hypocreales │ │ ├─o Bionectriaceae │ │ ├─o Ceratostomataceae │ │ ├─o Clavicipitaceae │ │ ├─o Hypocreaceae │ │ ├─o Nectriaceae │ │ └─o Niessliaceae │ └─o Sordariomycetidae │ ├─? Annulatascaceae │ ├─? Cephalothecaceae │ ├─? Helminthosphaeriaceae │ ├─? Papulosaceae │ ├─o Boliniales │ ├─o Chaetosphaeriales │ ├─o Coniochaetales │ ├─o Ophistomatales │ │ ├─o Kathistaceae │ │ └─o Ophiostomataceae │ ├─o Sordariales │ │ ├─o Chaetomiaceae │ │ ├─o Lasiosphaeriaceae │ │ └─o Sordariaceae │ └─o Diaporthales │ ├─o Diaporthaceae │ ├─o Gnomoniaceae │ ├─o Melanconidaceae │ ├─o Togniniaceae │ ├─o Valsaceae │ └─o Vialaeaceae ├─o Laboulbeniomycetes │ ├─o Pixidiophorales │ └─o Laboulbeniales │ ├─o Ceratomycetaceae │ ├─o Euceratomycetaceae │ ├─o Herpomycetaceae │ └─o Laboulbeniaceae └─o ├─o Eurotiomycetes │ ├─o Mycocaliciomycetidae ou Mycocaliciales │ │ ├─o Mycocaliciaceae │ │ └─o Sphinctrinaceae │ └─o │ ├─o Chaetothyriomycetidae │ │ ├─? Rhynchostomataceae │ │ ├─? Strigulaceae │ │ ├─o Pyrenulales │ │ │ ├─o Massariaceae │ │ │ ├─o Monoblastiaceae │ │ │ ├─o Pyrenulaceae │ │ │ └─o Requienellaceae │ │ └─o │ │ ├─o Chaetothyriales │ │ │ ├─o Chaetothyriaceae │ │ │ └─o Herpotrichiellaceae │ │ └─o Verrucariales │ │ ├─o Adelococcaceae │ │ └─o Verrucariaceae │ └─o Eurotiomycetidae │ ├─o Coryneliales │ └─o │ ├─o Ascosphaerales │ │ ├─o Ascosphaeraceae │ │ └─o Eremascaceae │ ├─o Eurotiales │ │ ├─o Elaphomycetaceae │ │ ├─o Monascaceae │ │ └─o Trichocomaceae │ └─o │ ├─o Arachnomycetales │ └─o Onygenales │ ├─o Ajellomycetaceae │ ├─o Arthrodermataceae │ ├─o Gymnoascaceae │ └─o Onygenaceae └─o Lecanoromycetes ├─o Acarosporomycetidae ou Acarosporales │ ├─o Acarosporaceae │ └─o Hymeneliaceae └─o ├─o │ ├─o Umbilicariaceae │ └─o │ ├─o Agyriales │ │ ├─o Agyriaceae │ │ ├─o Elixiaceae │ │ └─o Anamylopsoraceae │ └─o Ostropomycetidae │ ├─o Pertusariales │ │ ├─? Megasporaceae │ │ ├─o Icmadophilaceae │ │ └─o │ │ ├─o Coccotremataceae │ │ └─o Pertusariaceae │ └─o │ ├─o Baeomycetales │ └─o Ostropales │ ├─? Asterothyriaceae │ ├─? Graphidaceae │ ├─? Odontotremataceae │ ├─? Phaneromycetaceae │ ├─? Solorinellaceae │ ├─o Trapeliopsis │ └─o │ ├─o Placopsis │ └─o │ ├─o Stictidaceae │ └─o Gyalectales │ ├─o Coenogoniaceae │ └─o │ ├─o Gyalectaceae │ └─o Thelotremataceae ├─? Trichotheliales │ ├─o Myeloconidaceae │ └─o Porinaceae └─o Lecanoromycetidae ├─? Anziaceae ├─? Arctomiacea ├─? Arthrorhaphidaceae ├─? Bacidiaceae ├─? Biatorellaceae ├─? Brigantiaeaceae ├─? Catillariaceae ├─? Cetradoniaceae ├─? Cladoniaceae ├─? Candelariaceae ├─? Crocyniaceae ├─? Dactylosporaceae ├─? Ectolechiaceae ├─? Gypsoplacaceae ├─? Haematommataceae ├─? Lecanoraceae ├─? Lecideaceae ├─? Loxosporaceae ├─? Megalariaceae ├─? Megalosporaceae ├─? Micareaceae ├─? Miltideaceae ├─? Mycoblastaceae ├─? Ophioparmaceae ├─? Pachyascaceae ├─? Parmeliaceae ├─? Phlyctidaceae ├─? Pilocarpaceae ├─? Psoraceae ├─? Ramalinaceae ├─? Vezdaeaceae ├─o Porpidiaceae └─o ├─o │ ├─o Sphaerophoraceae │ └─o Stereocaulaceae └─o ├─o │ ├─o Rhizocarpaceae │ └─o │ ├─o Caliciales │ │ ├─o Caliciaceae │ │ └─o Physciaceae │ └─o Teloschistales │ ├─o Letrouitiaceae │ ├─o Fuscideaceae │ └─o Teloschistaceae └─o Peltigerales ├─? Coccocarpiaceae ├─o Collematineae │ ├─o Collemataceae │ ├─o Placynthiaceae │ └─o Pannariaceae └─o Peltigerineae ├─o Nephromataceae └─o ├─o Lobariaceae └─o Peltigeraceae
Débat scientifique relatif à la phylogénie des Ascomycota
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