Marqueur genetique

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Marqueur génétique

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Le marqueur génétique est une séquence polymorphe d'ADN aisément détectable, utilisée en cartographie génétique pour « baliser » le génome.

Jusqu'en 1980, les marqueurs génétiques étaient uniquement des gènes polymorphes, cartographiés à partir de l'analyse des phénotypes. Les nouvelles biotechnologies (PCR…) permettent une analyse directe du polymorphisme des séquences d'ADN pour dresser une carte génétique.

Il existe différentes sortes de marqueurs : STS, RFLP, microsatellites, minisatellites, RAPD, SNP, EST, gènes...

Caractéristiques

Selon Bretting et Widrlechner (1995), les conditions idéales d'un marqueur génétique sont les suivantes[1] :

  • être polymorphe, afin de pouvoir facilement différencier les individus ou les lignées ;
  • être relativement neutre, que ce soit au niveau de la valeur du caractère étudié que de la valeur sélective ;
  • être codominant, afin de pouvoir distinguer les hétérozygotes des homozygotes ;
  • être un caractère mendélien à hérédité simple
  • ne pas être pléiotropique ou épistatique
  • être dispersé le long du génome
  • ne pas être lié à un autre marqueur
  • être stable quel que soit le stade du développement
  • ne pas avoir d'impact sur la croissance ou la reproduction sexuée
  • être facilement observable, sans ambiguïté possible
  • être peu coûteux

Notes et références

  1. Daniel Prat & al, Analyse du génome et gestion des ressources génétiques forestières [lire en ligne], pp. 73-74, éd. Quae, 2006, 456 p. (ISBN 2738012272).

A ne pas confondre

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