- Entrez
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Le système global de recherches inter-bases de données Entrez (en anglais Entrez Global Query Cross-Database Search System) permet d'accéder à des bases de données du site internet du National Center for Biotechnology Information (NCBI). Le NCBI fait partie de la National Library of Medicine (NLM), qui est elle-même un département des National Institutes of Health (NIH) du gouvernement des États-Unis.
Sommaire
Recherches
Bases de Données
Entrez permet de faire une recherche globale ou filtrée dans les bases de données suivantes:
- All Databases: recherche dans toutes les bases de donnée ci-dessous
- NCBI web site: NCBI web and FTP web sites
- PubMed: littérature scientifique et biomédicale avec le plus souvent accès aux résumés (abstracts). La consultation de l'article intégral est également possible pour certains journaux lorsqu'un lien a été établi avec l'éditeur.
- Protein: recherche de séquences de protéines
- Nucleotide: recherche de séquences de nucléotides (GenBank)
- EST: Expressed Sequence Tags Database
- GSS: Genome Survey Sequences Database
- Structure: structures macromoléculaires en 3D
- Genome: séquences complètes de génomes Mapping
- BioSystems: voies métaboliques et systèmes biologiques
- Books: livres en ligne
- CancerChromosomes: aberrations cytogénétiques des cancers
- Conserved domains: domaines conservés des protéines
- 3D Domains: domaines de protéines en 3D
- Epigenomics: modifications qui contrôlent l'expression des gènes
- Gene: information complète sur les gènes
- Genome Project: informations issues du Human Genome Project
- dbGAP: génotypes et phénotypes (database of Genotypes and Phenotypes)
- dbVar: variations structurelles de l'ADN (inversions, translocations, insertions et délétions)
- GENSAT: atlas d'expression de gènes du système nerveux central de la souris
- GEO Profiles: profils d'expression de gènes
- HomoloGene: séquences homologues chez des groupes eucaryotes
- Images:images, figures et tableaux provenant des articles déposés dans PubMed Central
- MeSH: Catalogue des descripteurs (Medical Subject Headings)
- NLM Catalog: données bibliographiques de la bibliothèque Nationale de Médecine américaine (NLM)
- OMIM: transmission mendelienne chez l'homme
- OMIA: transmission mendelienne chez l'animal
- Peptidome: données d'identification de peptides et de protéines par spectrographie de masse en tandem
- PMC: Pubmed Central, sous-ensemble de Pubmed comportant l'intégralité des articles accessibles librement
- PopSet: données sur l'étude des populations (épidémiologie)
- Probe: séquences spécifiques pour sondes moléculaires
- Protein cluster:
- PubChem BioAssay: bioactivité des substances chimiques
- PubChem Compound: activité biologique et structure chimique de composés uniques
- PubChem Substance: activité biologique et structure chimique de composés complexes
- SNP: polymorphismes nucléotidiques simples
- SRA: données issues du séquençage de dernière génération (Short Read Archive (SRA))
- Taxonomy: organismes dans GenBank Taxonomie
- UniGene: groupe de séquences transcrites issues d'un même gène
- UniSTS: séquences uniques de l'ADN dont la localisation est la position sont connues
Genbank
Article principal : GenBank
Catalogue NLM
Voir aussi
- Ressources en chimie
Lien externe
Catégories :- Bio-informatique
- Application de base de données
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