DNALinux

DNALinux
DNALinux
Famille GNU/Linux
Type de noyau Noyau monolithique
État du projet en cours
Licence GNU GPL
États des sources Logiciel libre
Site web dnalinux.com

DNALinux est une distribution Linux disponible sous forme de live CD incluant des outils de bio-informatique. Si la version 0.5 est basé sur Slax, les versions plus récentes, nommées VDE (Virtual Desktop Edition), sont basées sur Xubuntu.

Logiciels disponibles dans DNALinux VDE :

  • NCBI BLAST 2.2.16
  • NCBI NetBLAST 2.2.16
  • EMBOSS 4.1.0
  • ESIM4 (EMBOSS SIM4)
  • MSE 1.0.0
  • Phylip 3.6b
  • Biopython 1.43
  • BioPerl
  • Kalign 1.04
  • Clustalx and Clustalw 1.83
  • njplot
  • Polyxmass 0.9.7
  • Primer3
  • Rasmol 2.7.2.1.1
  • Sigma-align 1.0
  • t_coffe 2.50
  • xviewg
  • Treeviewx 0.5.1
  • hmmer 2.3.2
  • NCBI-epcr
  • Cn3D NCBI Database Viewer
  • DDV Sequence Alignment Viewer
  • Entrez NCBI Database Querying Tool
  • OneD Biological Sequence Viewer
  • PyMOL Molecular Graphics System
  • Sequin DNA Sequence Submission Tool

Voir aussi

Article connexe

Lien externe


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Contenu soumis à la licence CC-BY-SA. Source : Article DNALinux de Wikipédia en français (auteurs)

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