- Chimiokine
-
Structure en solution de l'Interleukine 8, une chimiokine de la sous-famille CXC
Les chimiokines (cytokines chimioattractantes) sont une famille de petites protéines, majoritairement solubles, de 8-14 kilodaltons. Leur fonction la plus étudiée est l'attraction (chimiotactisme) et le contrôle de l'état d'activation des cellules du système immunitaire. D'autres fonctions leur ont été aussi attribuées, dans le développement embryologique ou la physiologie du système nerveux par exemple. Elles sont caractérisées par la présence de quatre résidus cystéine en des positions conservées nécessaires à la formation de leur structure tridimensionnelle.
Les chimiokines sont retrouvées chez tous les vertébrés, certains virus et certaines bactéries, mais aucune n'a encore été décrite chez les invertébrés.
Sommaire
Histoire
Historiquement, ces protéines ont été connues sous d'autres noms comme la famille SIS des cytokines, la famille SIG des cytokines, la famille SCY des cytokines, la superfamille du facteur-4 plaquettaire ou les intercrines.
Classification
Chimiokines CC Name Gene Autre(s) nom(s) Uniprot CCL1 Scya1 I-309, TCA-3 P22362 CCL2 Scya2 MCP-1 P13500 CCL3 Scya3 MIP-1α P10147 CCL4 Scya4 MIP-1β P13236 CCL5 Scya5 RANTES P13501 CCL6 Scya6 C10, MRP-2 P27784 CCL7 Scya7 MARC, MCP-3 P80098 CCL8 Scya8 MCP-2 P80075 CCL9/CCL10 Scya9 MRP-2, CCF18, MIP-1γ P51670 CCL11 Scya11 Eotaxin P51671 CCL12 Scya12 MCP-5 Q62401 CCL13 Scya13 MCP-4, NCC-1, Ckβ10 Q99616 CCL14 Scya14 HCC-1, MCIF, Ckβ1, NCC-2, CCL Q16627 CCL15 Scya15 Leukotactine-1, MIP-5, HCC-2, NCC-3 Q16663 CCL16 Scya16 LEC, NCC-4, LMC, Ckβ12 O15467 CCL17 Scya17 TARC, dendrokine, ABCD-2 Q92583 CCL18 Scya18 PARC, DC-CK1, AMAC-1, Ckβ7, MIP-4 P55774 CCL19 Scya19 ELC, Exodus-3, Ckβ11 Q99731 CCL20 Scya20 LARC, Exodus-1, Ckβ4 P78556 CCL21 Scya21 SLC, 6Ckine, Exodus-2, Ckβ9, TCA-4 O00585 CCL22 Scya22 MDC, DC/β-CK O00626 CCL23 Scya23 MPIF-1, Ckβ8, MIP-3, MPIF-1 P55773 CCL24 Scya24 Eotaxine-2, MPIF-2, Ckβ6 O00175 CCL25 Scya25 TECK, Ckβ15 O15444 CCL26 Scya26 Eotaxine-3, MIP-4α, IMAC, TSC-1 Q9Y258 CCL27 Scya27 CTACK, ILC, Eskine, PESKY, skinkine Q9Y4X3 CCL28 Scya28 MEC Q9NRJ3 Chimiokines CXC Name Gene Other name(s) Uniprot CXCL1 Scyb1 Gro-α, GRO1, NAP-3 P09341 CXCL2 Scyb2 Gro-β, GRO2, MIP-2α P19875 CXCL3 Scyb3 Gro-γ, GRO3, MIP-2β P19876 CXCL4 Scyb4 PF-4 P02776 CXCL5 Scyb5 ENA-78 P42830 CXCL6 Scyb6 GCP-2 P80162 CXCL7 Scyb7 NAP-2, CTAPIII, β-Ta, PEP P02775 CXCL8 Scyb8 IL-8, NAP-1, MDNCF, GCP-1 P10145 CXCL9 Scyb9 MIG, CRG-10 Q07325 CXCL10 Scyb10 IP-10, CRG-2 P02778 CXCL11 Scyb11 I-TAC, β-R1, IP-9 O14625 CXCL12 Scyb12 SDF-1, PBSF P48061 CXCL13 Scyb13 BCA-1, BLC O43927 CXCL14 Scyb14 BRAK, bolekine O95715 CXCL15 Scyb15 Lungkine, WECHE Q9WVL7 CXCL16 Scyb16 SRPSOX Q9H2A7 CXCL17 VCC-1 DMC, VCC-1 Q6UXB2 Chimiokines C Name Gene Autre(s) nom(s) Uniprot XCL1 Scyc1 Lymphotactine α, SCM-1α, ATAC P47992 XCL2 Scyc2 Lymphotactine β, SCM-1β Q9UBD3 Chimiokines CX3C Name Gene Autre(s) nom(s) Uniprot CX3CL1 Scyd1 Fractalkine, Neurotactine, ABCD-3 P78423 Les chimiokines sont classées en quatre sous familles en fonction de l'espacement entre deux de leurs cystéines en position N-terminale. La famille CXC ou alpha, dont les membres possèdent un acide aminé entre les deux premières cystéines.
La famille CC ou beta, dont les membres possèdent deux premières cystéines adjacentes
La famille CX3C ou delta, dont l'unique membre (la Fractalkine) possède trois acides aminés entre les deux premières cystéines.
La famille C ou gamma, dont l'unique membre ne possède qu'une seule cystéine
Rôles biologiques
Toutes les chimiokines exercent leurs fonctions en se fixant sur des récepteurs couplés aux protéines G. Certaines chimiokines sont considérées comme pro-inflammatoires. La sécrétion de ces chimiokines peut être induite lors de la réponse immune afin de favoriser l'arrivée de cellules du système immunitaire au niveau d'un site infectieux (notamment en activant l' integrine des phagocytes). D'autres chimiokines sont impliquées dans le contrôle de la migration de cellules au cours des processus de maintenance tissulaire ou au cours développement. Une chimiokine particulière, la Fractalkine, est exprimée sous la forme d'une protéine membranaire et présente certaines propriétés dans l'adhérence cellulaire. Cependant, son clivage membranaire est possible libérant la protéine soluble pour une action paracrine.
Notes et références
Portail de la biologie cellulaire et moléculaire
Wikimedia Foundation. 2010.
