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Bioclipse 
Développeur Le projet Bioclipse Dernière version 2.0.1 (5 août 2009) [+/-] Version avancée 2.1.0 v20090807 (7 août 2009) [+/-] Environnement Multiplate-forme Type Chemo-informatique/Bio-informatique Licence Eclipse Public License Site web www.bioclipse.net modifier 
Bioclipse est un projet développé en Java et open source. Il s'agit d'une plate-forme de visualisation pour la chemo- et la bio-informatique basée sur la plateforme client riche Eclipse.
Bioclipse utilise une architecture à base de plugins qui hérite des fonctionnalités de base et des interfaces graphiques d'Eclipse, tels que le système d'aide, l'interface de mise à jour du logiciel, la gestion des préférences, le déployement multiplate-forme, etc. Grâce à ces plugins, Bioclipse fournit de nombreuses fonctions pour la chémo- et la bio-informatique, et propose des possibilités d'extension qui permettent d'ajouter facilement de nouvelles fonctionnalités.
La première version stable de Bioclipse inclut un plugin CDK (back-end de chemo-informatique), un plugin Jmol pour la visualisation 3D et un plugin BioJava pour l'analyse de séquences. Bioclipse est développé par un consortium de laboratoires :
- Proteochemometric Group (université d'Uppsala, Suède)
- Chemoinformatics and Metabolism Team (EBI, Royaume-Uni)
- Division of Analytical Biosciences (université de Leyde, Pays-Bas)
Ces développements ont été enrichies par de nombreuses contributions d'autres laboratoires académiques.
Voir aussi
Liens externes
- (en) Page officiel de Bioclipse
- (en) Page du projet sur SourceForge
- (en) Le wiki
Références
- Ola Spjuth, Tobias Helmus, Egon L Willighagen, Stefan Kuhn, Martin Eklund, Johannes Wagener, Peter Murray-Rust, Christoph Steinbeck, Jarl E.S. Wikberg
Bioclipse: An open source workbench for chemo- and bioinformatics,
BMC Bioinformatics, 2007, 8. DOI:10.1186/1471-2105-8-59
Catégories :- Eclipse
- Bio-informatique
- Chémoinformatique
- Logiciel sous licence libre
- Plateforme Java
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