- Promoteur (biologie)
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Un promoteur, ou séquence promotrice, est une région de l'ADN située à proximité d'un gène et indispensable à la transcription de l'ADN en ARN. Le promoteur est la zone de l'ADN sur laquelle se fixe initialement l'ARN polymérase, avant de démarrer la synthèse de l'ARN. Les séquences promotrices sont en général situées en amont du site de démarrage de la transcription[1].
La fixation et l'activation de l'ARN polymérase sont contrôlées par des facteurs de transcription (éléments trans-régulateurs) qui se fixent au niveau de séquences cis-régulatrices spécifiques classiquement appelées éléments de réponse, situées à des distances variables du site de démarrage de la transcription. Les facteurs de transcription peuvent être soit des activateurs, soit des répresseurs de la transcription. Par ailleurs, l'ADN n'est pas libre dans le noyau mais enroulé en une structure particulière appelée nucléosomes et associée à des protéines non-histones. L'état de condensation de cette structure chromatinienne au niveau des promoteurs des gènes conditionne leur transcription.
À partir de l'analyse de la séquence de différentes régions promotrices, des séquences consensus ont été établies, dont il en existe plusieurs sortes. La première séquence découverte chez les procaryotes est la Pribnow box ou boîte de Pribnow[2], équivalente de la boîte TATA chez les eucaryotes. Cette séquence, dont le consensus est TATAAT est localisée 10 nucléotides en amont du site de démarrage de la transcription.
Sommaire
Promoteur procaryotique de type TATA box
<-- amont aval --> 5'-XXXXXXXPPPPPXXXXXXPPPPPPXXXXGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGXXXX-3' -35 -10 gène d'intérêt (L'espacement optimal entre les régions -35 et -10 est de 17 nucléotides)Probabilité d'observation pour chaque nucléotide
séquence en -10 T A T A A T 77% 76% 60% 61% 56% 82%
séquence en -35 T T G A C A 69% 79% 61% 56% 54% 54%
Séquences promotrices eucaryotes
L'organisation des séquences promotrices est très différente entre les procaryotes et les eucaryotes. Elle est beaucoup plus complexe chez les eucaryotes.
On distingue plusieurs éléments principaux sur le promoteur des ARNm eucaryotes (core elements) :
- le TFIIB Responsive Element (BRE) en 5' du site d'initiation de la transcription (TSS).
- la boîte TATA, en 5' du TSS et en 3' de BRE, entre les positions -23 et -33.
- la séquence Inr, ou initiator, correspondant au TSS.
- le Motif Ten Element (MTE), en 3' du TSS
- le Distal Promoter Element (DPE) en 3' du MTE
Ces éléments ne sont cependant pas observés dans l'ensemble des promoteurs eucaryotes et ne sont pas nécessaires à l'initiation de la transcription
Notes et références
- Biologie cellulaire, Dunod 2è éd, JC Callen, p87 et Biologie cellulaire et moléculaire, Dunod 2è éd, Bolsover, Hyams, Shepard, White, Wiedemann, p120
- D. Pribnow (1975) Nucleotide sequence of an RNA polymerase binding site at an early T7 promoter, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 72: 784-788
Article connexe
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