- Lipocaline
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Les lipocalines sont une famille de protéines qui servent au transport de petites molécules hydrophobes telles que les stéroïdes, les sels biliaires, les rétinoïdes et les lipides. Elles partagent des régions de séquences homologues et une architecture tertiaire commune[1],[2],[3],[4],[5]. Il s'agit de huit feuillets beta antiparallèles en forme de tonneau ouvert avec dans son creux un site de liaison au ligand[4],[3]
Ces protéines se trouvent dans les bactéries gram négatif, les cellules de vertébrés, d'invertébrés et de végétaux. Les lipocalines ont été associées à de nombreux processus biologiques, comme la réponse immunitaire, le transport de phéromones, la synthèse des prostaglandines, les fixations de rétinoïdes et les interactions entre cellules cancéreuses.
Sommaire
Rôles
Réponse immunitaire
Les lipocalines sont impliquées dans les processus inflammatoires et de désintoxication provoqués par l'activation du système immunitaire chez les mammifères. Elles sont des allergènes respiratoires connus des souris, chats, chiens, chevaux et autres animaux. Des exemples de lipocalines impliquées dans la réponse du système immunitaire sont l'alpha-1-microglobuline, l'alpha-1-glycoprotéine acide et le c8gamma. Les informations structurales du système immunitaire qui interfèrent avec les lipocalines sont assez bien connues alors que leur rôle exact dans les systèmes biologiques est encore peu clair. Les allergies humaines aux lipocalines n'ont pas été étudiées de façon approfondie.
Transport de phéromones
La famille des lipocaline est liée au transport des phéromones chez les mammifères comme le montre facilement l'observation des interactions protéine-phéromone. Les lipocalins sont des protéines de relativement petite taille et sont donc moins compliquées à étudier que les grandes et encombrantes protéines. Elles peuvent également se lier à différents ligands à différentes fins biologiques. Les lipocalins sont des protéines de transport de phéromones importantes dans le mucus nasal des rongeurs. Les protéines urinaires majeures, une sous-famille de lipocalines, se retrouvent dans l'urine des rats et des souris et peuvent elles-mêmes agir en tant que phéromones protéiques[6].
Synthèse des prostaglandines
Article détaillé : Prostaglandine.Cette famille de protéines joue un rôle dans la partie terminale de la synthèse biologique des prostaglandines.
Références
- (en) Cet article est partiellement ou en totalité issu de l’article de Wikipédia en anglais intitulé « Lipocalin » (voir la liste des auteurs)
- S Pervaiz, K Brew, « Homology and structure-function correlations between alpha 1-acid glycoprotein and serum retinol-binding protein and its relatives », dans FASEB J., vol. 1, no 3, 1987, p. 209–214 [lien PMID]
- A Nagata, M Igarashi, H Toh, Y Urade, O Hayaishi, « Structural organization of the gene for prostaglandin D synthase in the rat brain », dans Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., vol. 89, no 12, 1992, p. 5376–5380 [lien PMID, lien DOI]
- SW Cowan, TA Jones, ME Newcomer, « Crystallographic refinement of human serum retinol binding protein at 2A resolution », dans Proteins, vol. 8, no 1, 1990, p. 44–61 [lien PMID, lien DOI]
- DR Flower, TK Attwood, AC North, « Structure and sequence relationships in the lipocalins and related proteins », dans Protein Sci., vol. 2, no 5, 1993, p. 753–761 [lien PMID, lien DOI]
- J Godovac-Zimmermann, « The structural motif of beta-lactoglobulin and retinol-binding protein: a basic framework for binding and transport of small hydrophobic molecules? », dans Trends Biochem. Sci., vol. 13, no 2, 1988, p. 64–66 [lien PMID, lien DOI]
- P Chamero, TF Marton, QW Logan, et al., « Identification of protein pheromones that promote aggressive behaviour », dans Nature, vol. 450, no 7171, décembre 2007, p. 899–902 [lien PMID, lien DOI]
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