Mismatch(biologie moléculaire)

Mismatch(biologie moléculaire)

Paire de bases

Les paires de bases (en gris clair) relient les deux brins de l'ADN (en gris foncé).

Une paire de bases, en abrégé pb, désigne l'appariement de deux bases azotées situées sur deux brins complémentaires d'ADN ou ARN. Cet appariement est effectué par des ponts hydrogènes.

Dans l'ADN, on observe des paires dites canoniques, ou encore, paires Watson-Crick : l'adénine (symbole A) s'apparie avec la thymine (T) grâce à deux ponts hydrogénés, et la guanine (G) s'apparie avec la cytosine (C) par trois ponts hydrogènes. Dans l'ARN, la thymine est remplacée par l'uracile (U). Au cours de la réplication de l'ADN, il peut arriver que l'ADN polymérase fasse des erreurs en recopiant le brin d'ADN matrice. Dans ce cas, la paire de bases normale ne peut se former et la double hélice contient un défaut, appelé mésappariement ou mismatch.

On peut également trouver dans l'ARN des paires de bases non canoniques, ou non Watson-Crick. Dans ce cas là, les bases peuvent s'associer entre elles, en fonction es atomes accepteurs d'un côté et donneurs de liaison hydrogène de l'autre. On observe en particulier ce type d'appariements, appelés paires wobble dans l'interaction entre ARNt et ARNm.

Unités de mesure

La longueur des molécules d'ADN ou d'ARN est comptée en paires de bases. Cette unité est notée bp (en anglais base pairs). Voir les liens suivants:

Pour les ADN et ARN simple brin, on compte plutôt en nucléotides qu'en paires de bases. Cette unité est notée nt.

Les liaisons hydrogène, liaisons entre les bases

Les liaisons hydrogène sont le mécanisme chimique qui régit la complémentarité des bases. Cette correspondance est unique grâce à la géométrie des atomes donneurs d'hydrogène et les accepteurs qui forment les bases.

les dimensions de la molécule

La molécule en double hélice de l'ADN a un diamètre de 2 nm ( nanomètres ) et un pas de 3,4 nm. Sachant qu'il y a dix paires de bases par pas, on peut considérer ( même si c'est une approximation discutable sur le plan mathématique ) que deux paires sont distantes de 0,34 nm

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