Marqueurs génétiques
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Marqueur génétique
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marqueur.
Le marqueur génétique est une séquence polymorphe d'ADN aisément détectable, utilisée en cartographie génétique pour « baliser » le génome.
Jusqu'en 1980, les marqueurs génétiques étaient uniquement des gènes polymorphes, cartographiés à partir de l'analyse des phénotypes. Les nouvelles biotechnologies (PCR…) permettent une analyse directe du polymorphisme des séquences d'ADN pour dresser une carte génétique.
Il existe différentes sortes de marqueurs : STS, RFLP, microsatellites, minisatellites, RAPD, SNP, EST, gènes...
Caractéristiques
Selon Bretting et Widrlechner (1995), les conditions idéales d'un marqueur génétique sont les suivantes[1] :
- être polymorphe, afin de pouvoir facilement différencier les individus ou les lignées ;
- être relativement neutre, que ce soit au niveau de la valeur du caractère étudié que de la valeur sélective ;
- être codominant, afin de pouvoir distinguer les hétérozygotes des homozygotes ;
- être un caractère mendélien à hérédité simple
- ne pas être pléiotropique ou épistatique
- être dispersé le long du génome
- ne pas être lié à un autre marqueur
- être stable quel que soit le stade du développement
- ne pas avoir d'impact sur la croissance ou la reproduction sexuée
- être facilement observable, sans ambiguïté possible
- être peu coûteux
Notes et références
- ↑ Daniel Prat & al, Analyse du génome et gestion des ressources génétiques forestières [lire en ligne], pp. 73-74, éd. Quae, 2006, 456 p. (ISBN 2738012272).
A ne pas confondre
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2010.
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