- Amoebozoa (classification phylogénétique)
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Cette page a pour objet de présenter un arbre phylogénétique des Amoebozoa (Amœbozoaires, Amibes), c'est-à-dire un cladogramme mettant en lumière les relations de parenté existant entre leurs différents groupes (ou taxa), telles que les dernières analyses reconnues les proposent. Ce n'est qu'une possibilité, et les principaux débats qui subsistent au sein de la communauté scientifique sont brièvement présentés ci-dessous, avant la bibliographie.
Sommaire
Arbre phylogénétique
À la suite d'un taxon, sa période d'apparition, quand elle est connue, peut être indiquée suivant la légende suivante : (Plé) : Pléistocène ; (Pli) : Pliocène ; (Mio) : Miocène ; (Oli) : Oligocène ; (Éoc) : Éocène ; (Pal) : Paléocène ; (Cré) : Crétacé ; (Jur) : Jurassique ; (Tri) : Trias ; (Per) : Permien ; (Car) : Carbonifère ; (Dév) : Dévonien ; (Sil) : Silurien ; (Ord) : Ordovicien ; (Camb) : Cambrien. De plus, pour plus de précisions si possible, (-) : inférieur ; (~) : moyen ; (+) : supérieur.
Le symbole ▲ renvoie à la partie immédiatement supérieure de l'arbre phylogénétique du vivant. Le signe ► renvoie à la classification phylogénétique du groupe considéré.
Tout nœud de l'arbre portant plus de deux branches montre une indétermination de la phylogénie interne du groupe considéré. Le symbole ... indique que le nœud qu'il désigne n'a pas (encore) reçu de nom reconnu par la communauté scientifique.
▲ └─o Amoebozoa ├─o Tubulinea │ ├─o Leptomyxida │ └─o │ ├─o Tubulinida │ └─o Testacealobosea │ └─o Arcellinida └─o ├─o Flabellinea │ ├─o Himatismenida │ └─o │ ├─o Dactylopodida ou Conopodina │ └─o Vannellida └─o ├─o │ ├─o Acanthamoebida ou Acanthopodina │ ├─o Thecamoebida │ └─? Stereomyxidae └─o Conosea ├─o Phalansterea └─o ├─o Filamoebidae └─o Conosa ├─o Archamoebae └─o Mycetozoa
Arbre développé▲ └─o Amoebozoa ├─o Tubulinea │ ├─o Echinamoeba │ └─o │ ├─o Leptomyxida │ │ ├─o Flabellulidae │ │ └─o Leptomyxidae │ └─o │ ├─o Tubulinida │ │ └─o Hartmannellidae et Amoebidae │ └─o Testacealobosea │ ├─? Trichosidae │ └─o Arcellinida │ ├─o Phryganellina │ │ ├─o Phryganellidae │ │ └─o Cryptodifflugiidae │ ├─? Difflugiidae │ ├─? Lamtopyxidae │ ├─? Distomatopyxidae │ ├─? Plagiopyxidae │ ├─? Paraquadrulidae │ ├─? Lesquereusidae │ ├─o Heleoperidae │ └─o │ ├─o Hyalospheniidae ou Nebelidae │ └─o │ ├─o Trigonopyxidae │ └─o │ ├─o Centropyxidae │ └─? Arcellina │ ├─o Arcellidae │ ├─o Microcoryciidae │ └─o Microchlamyiidae └─o ├─o Flabellinea │ ├─o Himatismenida ou Cochliopodiidae │ └─o │ ├─o Mayorella │ └─o │ ├─o Dermamoeba │ └─o │ ├─o Dactylopodida ou Conopodina │ └─o Vannellida └─o ├─o │ ├─o Centramoebida │ │ ├─o Acanthamoebidae ou Acanthopodina │ │ └─o Balamuthiidae │ ├─o Thecamoebida │ └─? Stereomyxida │ ├─o Stereomyxidae │ └─o Corallomyxidae └─o Conosea ├─o Phalansterea └─o ├─o │ ├─o Multicilia │ └─o Gephyramoeba └─o ├─o Filamoebidae └─o Conosa ├─o Archamoebae │ ├─o Pelobiontida │ │ ├─o Pelomyxidae │ │ └─o Entamoebidae │ └─o Mastigamoebida │ ├─o Endolimax │ └─o Mastigamoebidae └─o Mycetozoa ├─o Guttulinia ├─o Hyperamoebae └─o Eumycetozoa ├─o Dictyosteliida │ ├─o Acytosteliidae │ └─o Dictyosteliidae └─o Eumyxa ├─o Protostelia │ ├─o Echinosteliopsida │ └─o Protosteliida │ ├─o Cavosteliidae │ ├─o Ceratiomyxidae │ └─o Protosteliidae └─o Myxogastria ├─o Liceida │ ├─o Liceidae │ ├─o Listerellidae │ └─o Enteridiidae ├─o Trichiida │ ├─o Dianemidae │ └─o Trichiidae ├─o Stemonitida └─o Myxogastromycetidae ├─o Echinosteliida │ ├─o Echinosteliidae │ └─o Clastodermidae └─o Physarida ├─o Elaeomyxidae ├─o Physaridae └─o Didymiidae
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Lycogala epidendrum (Mycetozoa, Reticulariaceae)
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Thecamoeba striata (Amoebozoa)
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Reticularia lycoperdon (Mycetozoa, Reticulariaceae)
Débat scientifique relatif à la phylogénie des Amoebozoa
Classification proposée par Adl et al. 2005
Ce comité a proposé une nouvelle classification, remplaçant celle des anciens Protistes et tenant compte des phylogénies moléculaires récentes. Elle regroupe les Eucaryotes en six groupes réputés monophylétiques. Voici ce qui concerne les Amoebozoa.
Classification proposée par Adl et al. 2005▲ └─o Amoebozoa ├─o Tubulinea │ ├─o Tubulinida │ ├─o Leptomyxida │ ├─o Testacealobosia │ │ ├─o Arcellinida │ │ └─? Trichosphaerium │ └─? Echinamoeba ├─o Flabellinea (paraphylétique) │ ├─o Dactylopodida │ ├─o Vannellida │ ├─o Thecamoebida (paraphylétique) │ ├─o Cochliopodium │ └─? divers genres ├─o Stereomyxida (peut-être paraphylétique) ├─o Acanthamoebidae ├─o Entamoebida ├─o Mastigamoebidae ├─o Pelomyxa ├─o Eumycetozoa │ ├─o Protostelia (paraphylétique) │ ├─o Myxogastria │ ├─o Dictyostelia │ └─? divers genres ├─? divers genres └─o Spongomonadida ├─o Phalansterium └─o Spongomonadidae
En savoir plus
Sources bibliographiques de référence
- Alexey Smirnov, Elena Nassonova, Cédric Berney, José Fahrni, Ignacio Bolivar et Jan Pawlowski : « Molecular Phylogeny and Classification of the Lobose Amoebae », Protist, vol. 156, n°2, pp. 129-142, 2005
- Sina M. Adl et alii : « The New Higher Level Classification of Eukaryotes », J. Eukaryot. Microbiol., vol. 52, n°5, pp. 399–451, 2005
Autres sources bibliographiques
- Thomas Cavalier-Smith (2003) « Protist phylogeny and the high-level classification of Protozoa », Europ. J. Protistol., 39, pp. 338-348
Sources internet
- Molecular phylogeny of amoeboid protists
- Mikko's Phylogeny Archive
- The Taxonomicon
- Palaeos.org
- Micro*scope
- NCBI Taxonomy Browser
- The Tree of Life Web Project
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