- Amoebozoa (classification phylogenetique)
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Amoebozoa (classification phylogénétique)
Cette page a pour objet de présenter un arbre phylogénétique des Amoebozoa (ou Amibes), c'est-à-dire un cladogramme mettant en lumière les relations évolutives complexes (relations groupes ancestraux - groupes descendants) existant entre les différents organismes vivants ou taxa, constituant ce groupe. Du fait de ses méthodes nouvelles basées sur la biologie moléculaire, la phylogénie, science récente à l'origine de la classification phylogénétique du vivant, est en plein essor et propose parfois des résultats en contradiction avec l'ancienne classification, majoritairement basée, elle, sur des critères morphologiques et physiologiques. Aussi, certains points particuliers font parfois encore l'objet de débats au sein de la communauté scientifique. L'objectif, s'il y a lieu, est également de présenter ces derniers ici.
Ce cladogramme présente aussi bien les groupes encore représentés aujourd'hui que ceux qui sont éteints (incluant les groupes fossiles).
À la suite d'un taxon, sa période d'apparition, quand elle est connue, peut être indiquée suivant la légende suivante : (Plé) : Pléistocène ; (Pli) : Pliocène ; (Mio) : Miocène ; (Oli) : Oligocène ; (Éoc) : Éocène ; (Pal) : Paléocène ; (Cré) : Crétacé ; (Jur) : Jurassique ; (Tri) : Trias ; (Per) : Permien ; (Car) : Carbonifère ; (Dév) : Dévonien ; (Sil) : Silurien ; (Ord) : Ordovicien ; (Camb) : Cambrien. De plus, pour plus de précisions si possible, (-) : inférieur ; (~) : moyen ; (+) : supérieur.
Le symbole ▲ renvoie à la partie immédiatement supérieure de l'arbre phylogénétique du vivant. Le signe ► renvoie à la classification phylogénétique du groupe considéré.
Sommaire
Arbre phylogénétique
▲ └─o Amoebozoa ├─? Breviata └─o ├─o Tubulinea │ ├─o Leptomyxida │ └─o │ ├─o Tubulinida │ └─o Testacealobosea │ └─o Arcellinida └─o ├─o Flabellinea │ ├─o Himatismenida │ └─o │ ├─o Dactylopodida ou Conopodina │ └─o Vannellida └─o ├─o │ ├─o Acanthamoebida ou Acanthopodina │ ├─o Thecamoebida │ └─? Stereomyxidae └─o Conosea ├─o Phalansterea └─o ├─o Filamoebidae └─o Conosa ├─o Archamoebae └─o Mycetozoa
Arbre développé▲ └─o Amoebozoa ├─? Breviata └─o ├─o Tubulinea │ ├─o Echinamoeba │ └─o │ ├─o Leptomyxida │ │ ├─o Flabellulidae │ │ └─o Leptomyxidae │ └─o │ ├─o Tubulinida │ └─o Testacealobosea │ ├─? Trichosidae │ └─o Arcellinida │ ├─o Phryganellina │ │ ├─o Phryganellidae │ │ └─o Cryptodifflugiidae │ ├─? Difflugiidae │ ├─? Lamtopyxidae │ ├─? Distomatopyxidae │ ├─? Plagiopyxidae │ ├─? Paraquadrulidae │ ├─? Lesquereusidae │ ├─o Heleoperidae │ └─o │ ├─o Hyalospheniidae ou Nebelidae │ └─o │ ├─o Trigonopyxidae │ └─o │ ├─o Centropyxidae │ └─? Arcellina │ ├─o Arcellidae │ ├─o Microcoryciidae │ └─o Microchlamyiidae └─o ├─o Flabellinea │ ├─o Himatismenida ou Cochliopodiidae │ └─o │ ├─o Mayorella │ └─o │ ├─o Dermamoeba │ └─o │ ├─o Dactylopodida ou Conopodina │ └─o Vannellida └─o ├─o │ ├─o Centramoebida │ │ ├─o Acanthamoebidae ou Acanthopodina │ │ └─o Balamuthiidae │ ├─o Thecamoebida │ └─? Stereomyxida │ ├─o Stereomyxidae │ └─o Corallomyxidae └─o Conosea ├─o Phalansterea └─o ├─o │ ├─o Multicilia │ └─o Gephyramoeba └─o ├─o Filamoebidae └─o Conosa ├─o Archamoebae │ ├─o Pelobiontida │ │ ├─o Pelomyxidae │ │ └─o Entamoebidae │ └─o Mastigamoebida │ ├─o Endolimax │ └─o Mastigamoebidae └─o Mycetozoa ├─o Guttulinia ├─o Hyperamoebae └─o Eumycetozoa ├─o Dictyosteliida │ ├─o Acytosteliidae │ └─o Dictyosteliidae └─o Eumyxa ├─o Protostelia │ ├─o Echinosteliopsida │ └─o Protosteliida │ ├─o Cavosteliidae │ ├─o Ceratiomyxidae │ └─o Protosteliidae └─o Myxogastria ├─o Liceida │ ├─o Liceidae │ ├─o Listerellidae │ └─o Enteridiidae ├─o Trichiida │ ├─o Dianemidae │ └─o Trichiidae ├─o Stemonitida └─o Myxogastromycetidae ├─o Echinosteliida │ ├─o Echinosteliidae │ └─o Clastodermidae └─o Physarida ├─o Elaeomyxidae ├─o Physaridae └─o Didymiidae
Débat scientifique relatif à la phylogénie des Amoebozoa
Classification proposée par Adl et al. 2005
Ce comité a proposé une nouvelle classification, remplaçant celle des anciens Protistes et tenant compte des phylogénies moléculaires récentes. Elle regroupe les Eucaryotes en six groupes réputés monophylétiques. Voici ce qui concerne les Amoebozoa.
Classification proposée par Adl et al. 2005▲ └─o Amoebozoa ├─o Tubulinea │ ├─o Tubulinida │ ├─o Leptomyxida │ ├─o Testacealobosia │ │ ├─o Arcellinida │ │ └─? Trichosphaerium │ └─? Echinamoeba ├─o Flabellinea (paraphylétique) │ ├─o Dactylopodida │ ├─o Vannellida │ ├─o Thecamoebida (paraphylétique) │ ├─o Cochliopodium │ └─? divers genres ├─o Stereomyxida (peut-être paraphylétique) ├─o Acanthamoebidae ├─o Entamoebida ├─o Mastigamoebidae ├─o Pelomyxa ├─o Eumycetozoa │ ├─o Protostelia (paraphylétique) │ ├─o Myxogastria │ ├─o Dictyostelia │ └─? divers genres ├─? divers genres └─o Spongomonadida ├─o Phalansterium └─o Spongomonadidae
En savoir plus
Sources bibliographiques de référence
- Marianne A. Minge, Jeffrey D. Silberman, Russell J.S. Orr, Thomas Cavalier-Smith, Kamran Shalchian-Tabrizi, Fabien Burki, Åsmund Skjæveland et Kjetill S. Jakobsen : « Evolutionary position of breviate amoebae and the primary eukaryote divergence », Proc. R. Soc. B, vol. 276, pp. 597-604, 2009
- Alexey Smirnov, Elena Nassonova, Cédric Berney, José Fahrni, Ignacio Bolivar et Jan Pawlowski : « Molecular Phylogeny and Classification of the Lobose Amoebae », Protist, vol. 156, n°2, pp. 129-142, 2005
- Sina M. Adl et alii : « The New Higher Level Classification of Eukaryotes », J. Eukaryot. Microbiol., vol. 52, n°5, pp. 399–451, 2005
Autres sources bibliographiques
- Thomas Cavalier-Smith (2003) « Protist phylogeny and the high-level classification of Protozoa », Europ. J. Protistol., 39, pp. 338-348
Sources internet
- Molecular phylogeny of amoeboid protists
- Mikko's Phylogeny Archive
- The Taxonomicon
- Palaeos.org
- Micro*scope
- NCBI Taxonomy Browser
- The Tree of Life Web Project
Liens internes
Lycogala epidendrum (Mycetozoa, Reticulariaceae)
Thecamoeba striata (Amoebozoa)
Reticularia lycoperdon (Mycetozoa, Reticulariaceae)
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