- ARN splicéosomal U4atac
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Un ARNsn U4atac. Les parties rouges sont les parties invariantes.
L’ARN splicéosomal U4atac est un petit ARN nucléaire (snRNA ou ARNpn) non codant entrant dans la composition des petites ribonucléoprotéines nucléaires U4atac.
Il est une composante essentielle du splicéosome mineur. Il est indispensable pour l'enlèvement de certains introns des eucaryotes (AT-AC, type-U12)[1].
On pense qu'U4atac s'apparie avec un autre composant du splicéosome mineur, l'ARNsn U6atac par deux régions de structure tige-boucle. On a montré que ces boucles interactives se révélaient être indispensables pour l'épissage in vivo[2]. U4atac contient également un site de liaison en 3' avec la protéine Sm dont a prouvé qu'il était essentiel pour l'activité d'épissage[2].
U4atac est l'analogue fonctionnel de l'ARNsn U4 du splicéosome majeur[2].
L'ARNsn U4atac de la drosophile a une structure tige-boucle supplémentaire en 3' pour une deuxième liaison Sm[3].
Références
- (en)Z. Lorkovic, R. Lehner, C. Forstner, A. Bart;, « Evolutionary conservation of minor U12-type spliceosome betweenplants and humans. », dans RNA, vol. 11, 2005, p. 1095–1107 [lien PMID, lien DOI]
- Shukla GC, Cole AJ, Dietrich RC, Padgett RA;, « Domains of human U4atac snRNA required for U12-dependent splicing invivo. », dans Nucleic Acids Res, vol. 30, 2002, p. 4650–4657 [lien PMID, lien DOI]
- Padgett RA, Shukla GC;, « A revised model for U4atac/U6atac snRNA base pairing. », dans RNA, vol. 8, 2002, p. 125–128 [lien PMID, lien DOI]
- (en)G. Shukla, R. Padgett, « Conservation of functional features of U6atac and U12 snRNAs betweenvertebrates and higher plants. », dans RNA, vol. 5, 1999, p. 525–538 [lien PMID, lien DOI]
Voir aussi
- Épissage
- Splicéosome
- ARN splicéosomal U1
- ARN splicéosomal U2
- ARN splicéosomal U4
- ARN splicéosomal U5
- ARN splicéosomal U6
- ARN splicéosomal U6atac
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