- Recombinaison virale du H5N1
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La recombinaison virale est un des deux modes naturels d'évolution de nombreux virus à ARN (ces derniers sont beaucoup plus instables que les virus à ADN).
Quand un organisme vivant est infecté par 2 virus, des fragments de gènes ou des gènes entiers peuvent être mélangés, et donner naissance à un nouveau virus viable ayant tout ou partie des propriétés des deux virus-source et/ou éventuellement de nouvelles propriétés (de virulence notamment). C'est le cas pour la grippe saisonnière, ou pour les virus grippaux hautement pathogènes.
Les généticiens et les éco-épidémiologues traquent des séquences particulières du génome, ici considérées comme marqueur, ou réputés correspondre à des caractéristiques de pathogénicité.
exemple :
Mi-2006, après la publication du séquençage d’un virus de la région d’Omsk (celui du village Maximovka, district de Tioukalinsk où 86 poules sont mortes récemment ?), Recombinomic estime que c’est un indice de plus plaidant en faveur de preuves que le virus se recombine activement et fréquemment : on y trouve un polymorphisme C1261T, assez commun dans un sous-ensemble d'isolats du H5N1 provenant du Lac Qinghai. Cependant, ce polymorphisme a aussi été détecté dans les isolats de deux malades en Indonésie. De même, un autre polymorphisme détecté sur ce virus n'a pas été trouvé dans d'autres isolats de Qinghai, mais avait été détecté chez un des deux patients indonésiens dont les virus présentaient le polymorphisme C1261T, et chez un patient indonésien qui avait été infecté en 2005.Liens internes
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