Projet:BBCM/Ressources

Cette page n'a pas la prétention de proposer une liste exhaustive des sites internet et ouvrages relatifs à la biochimie et à la biologie cellulaire et moléculaire, une telle liste serait sans fin... Son objectif est plutôt de présenter une sélection de sites et ouvrages particulièrement marquants, qu'ils soient généraux ou plus spécialisés sur un des nombreux domaines liés à ce domaine.

SITE OU OUVRAGE :      Particulièrement recommandé     -      Excellent / Fortement recommandé     -      Référence incontournable

- Niveau découverte (collège, lycée)

Bibliographie Garrett, R.H., Grisham, C.M., 2000. Biochimie. De Boeck (ed). Voet, D., Voet, J.G., 2005. Biochimie. De Boeck (ed). Koolman, J., Rôhm, K.H., 2004. Atlas de poche de biochimie. Flammarion. Weinman, S., Mehul, P., 2004. Toute la biochimie. Dunod. Eric Clauser, S. Conchon, 2004. Biochimie génétique, biologie moléculaire (abrégé). Masson. C. Ronsin, 2005. L'histoire de la biologie moléculaire. De Boeck. Scott F. Gilbert, 2004. Biologie du développement. De Boeck. Gerald Karp, 2004. Biologie cellulaire et moléculaire. De Boeck. Bruce Alberts, 1995. Biologie moléculaire de la cellule. Flammarion Medecine-Sciences. Bruce Alberts, 2005. Essentiel de la biologie cellulaire. Flammarion. J.C. Cailliez K. Verreman, 2004. Dictionnaire de biologie cellulaire et de biologie moléculaire. Ellipses. Marc Maillet. 2002. Biologie cellulaire abrégé. Masson. Jean-Claude Roland, Jean-Claude Callen, 2001. Atlas de biologie cellulaire. Dunod.

Internet Ressources de référence en biologie cellulaire et moléculaire (Univ. Bordeaux) CultureSciences - Vie - Adresses et liens sur le réseau WWW (Univ. Neuchâtel) Glossary of biochemistry General Chemistry Glossary Glossary of Biochemistry and Molecular Biology Biologie Cellulaire (Univ. Paris VI, Pierre-et-Marie-Curie) Cell Biology (University of Texas Medical Branch) Biologie Cellulaire

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Bibliographie (fr) Lubert Stryer, Jeremy Mark Berg, John L. Tymoczko (trad. Serge Weinman), Biochimie, Flammarion, « Médecine-Sciences », Paris, 2003, 5e éd. (ISBN 2-257-17116-0). (fr) Carl-Ivar Brändén, John Tooze (trad. Bernard Lubochinsky, préf. Joël Janin), Introduction à la structure des protéines, De Boeck Université, Bruxelles, 1996 (ISBN 2-804-12109-7). (en) Bruce Alberts B., Dennis Bray, Julian Lewis J., Martin Raff, et al., Molecular Biology of the Cell, Garland, New York; Londre, 1994, 3e éd. (ISBN 0-8153-1620-8). (en) Gunther Daum, Lipid Metabolism and Membrane Biogenesis, Springer, Berlin; New York, 2004 (ISBN 3-540-20752-X) (en) Dennis E. Vance, Biochemistry of Lipids, Lipoproteins and Membranes, Elsevier, Amsterdam; Boston; Paris, 2002, 4e éd. (ISBN 0-444-51138-5)

Internet International Union of Biochemistry and Molecular Biology Biochemistry (liste NCBI) ProtéoWiki - Encyclopédie de protéomique en ligne

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Bibliographie

Internet

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Bibliographie Biologie cellulaire de pollard et Earnshaw L'essentiel de la biologie cellulaire 2ème édition Biologie moléculaire de la cellule 4ème édition

Internet Ressources complètes et très bien illustrées, Université Bordeaux-1 Celldeath.de Société de biologie cellulaire de France The International Cell Death Society BMedia (Univ Pierre-et-Marie-Curie) Immunoportal

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Bioinformatique générale

Bibliographie

Internet ExPASy Proteomics Server Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes National Center for Biotechnology Information (NCBI) Online Informatics Resource for Dictyostelium Institut européen de bio-informatique : http://www.ebi.ac.uk/ Ensembl (génomes complets séquencés) : http://www.ensembl.org/ ReNaBI : French bioinformatics platforms network : http://www.renabi.fr/ Génopole de Toulouse Mydi-Pyrénées : http://www.genotoul.fr/ Centre de Ressources Infobiogen (CRI) : http://www.infobiogen.fr/ PRABI : Rhone-Alpes Bioinformatics Center : http://www.prabi.fr Pôle Bio-Informatique Lyonnnais (PBIL) : http://pbil.univ-lyon1.fr/ | http://pbil.ibcp.fr/ Société Française de BioInformatique Association des étudiants de la filière Bioinformatique d'Orsay

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Logiciels, programmation et bases de données

Logiciels et programmation BLAST (recherche de séquences dans les bases de données) : http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/ CLUSTAL W (alignement de séquences) : http://www.ebi.ac.uk/clustalw/ DbClustal (alignement utilisant comme ancres les résultats de blast) : http://bips.u-strasbg.fr Bioinformatics.org (ensemble de projets libres) : http://www.bioinformatics.org The Open Bioinformatics Foundation (promotion de logiciels libres pour la bio-informatique) : http://open-bio.org/ EMBOSS (ensemble d'outils libres pour l'analyse de séquences) : http://www.emboss.org/ BioPerl (Perl et la bio-informatique) : http://bioperl.org BioPython (Python et la bio-informatique): http://biopython.org BioJava (Java et la bio-informatique): http://biojava.org Phylogène (initiation à la phylogénie): http://www.inrp.fr/Acces/biotic/evolut/phylogene/accueil.htm PHYML (logiciel de phylogénie) : http://atgc.lirmm.fr/phyml/ Jmol (logiciel de visualisation de molécules en 3D) : http://www.jmol.org/

Bases de données EMBL (nucléotides): http://www.ebi.ac.uk/embl/ GenBank (nucléotides): http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Genbank/index.html UniProt Knowledgebase (protéines): http://www.ebi.ac.uk/uniprot/ SwissProt (protéines): http://www.expasy.org/ PDB - The Protein DataBank (structures tridimensionnelles de macromolécules biologiques) : http://www.rcsb.org/pdb/ The Genome Database : http://www.gdb.org/ Ensembl martView : http://www.ensembl.org/Multi/martview EBI MartView : http://www.ebi.ac.uk/BioMart/martview WormBase http://www.wormbase.org/ SGD (Saccharomyces Genome Database) : http://www.yeastgenome.org/

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