- Ressources en biologie cellulaire, moléculaire et bioinformatique
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Projet:BBCM/Ressources
BIOCHIMIE - BIOLOGIE CELLULAIRE & MOLÉCULAIRE - BIOINFORMATIQUE
Ressources bibliographiques et internet
Sommaire
Introduction généraleNiveau avancé :
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Note préliminaire...
Cette page n'a pas la prétention de proposer une liste exhaustive des sites internet et ouvrages relatifs à la biochimie et à la biologie cellulaire et moléculaire, une telle liste serait sans fin... Son objectif est plutôt de présenter une sélection de sites et ouvrages particulièrement marquants, qu'ils soient généraux ou plus spécialisés sur un des nombreux domaines liés à ce domaine.
SITE OU OUVRAGE : Particulièrement recommandé - Excellent / Fortement recommandé - Référence incontournable - Niveau découverte (collège, lycée)
Voir aussi le projet : Ressources en sciences de la vie [ modifier ]
Introduction générale
Bibliographie
- Garrett, R.H., Grisham, C.M., 2000. Biochimie. De Boeck (ed).
- Voet, D., Voet, J.G., 2005. Biochimie. De Boeck (ed).
- Koolman, J., Rôhm, K.H., 2004. Atlas de poche de biochimie. Flammarion.
- Weinman, S., Mehul, P., 2004. Toute la biochimie. Dunod.
- Eric Clauser, S. Conchon, 2004. Biochimie génétique, biologie moléculaire (abrégé). Masson.
- C. Ronsin, 2005. L'histoire de la biologie moléculaire. De Boeck.
- Scott F. Gilbert, 2004. Biologie du développement. De Boeck.
- Gerald Karp, 2004. Biologie cellulaire et moléculaire. De Boeck.
- Bruce Alberts, 1995. Biologie moléculaire de la cellule. Flammarion Medecine-Sciences.
- Bruce Alberts, 2005. Essentiel de la biologie cellulaire. Flammarion.
- J.C. Cailliez K. Verreman, 2004. Dictionnaire de biologie cellulaire et de biologie moléculaire. Ellipses.
- Marc Maillet. 2002. Biologie cellulaire abrégé. Masson.
- Jean-Claude Roland, Jean-Claude Callen, 2001. Atlas de biologie cellulaire. Dunod.
Internet
- CultureSciences -
- Vie -
- Adresses et liens sur le réseau WWW (Univ. Neuchâtel)
- Glossary of biochemistry
- General Chemistry Glossary
- Glossary of Biochemistry and Molecular Biology
- Biologie Cellulaire (Univ. Paris VI, Pierre-et-Marie-Curie)
- Ressources de Biologie Cellulaire Francophone (Univ. Bordeaux)
- Cell Biology (University of Texas Medical Branch)
- Biologie Cellulaire
* Portail Biochimie -- Portail Biologie cellulaire et moléculaire
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Biochimie - Protéomique
Bibliographie
- (fr) Lubert Stryer, Jeremy Mark Berg, John L. Tymoczko (trad. Serge Weinman), Biochimie, Flammarion, « Médecine-Sciences », Paris, 2003, 5e éd. (ISBN 2-257-17116-0).
- (fr) Carl-Ivar Brändén, John Tooze (trad. Bernard Lubochinsky, préf. Joël Janin), Introduction à la structure des protéines, De Boeck Université, Bruxelles, 1996 (ISBN 2-804-12109-7).
- (en) Bruce Alberts B., Dennis Bray, Julian Lewis J., Martin Raff, et al., Molecular Biology of the Cell, Garland, New York; Londre, 1994, 3e éd. (ISBN 0-8153-1620-8).
- (en) Gunther Daum, Lipid Metabolism and Membrane Biogenesis, Springer, Berlin; New York, 2004 (ISBN 3-540-20752-X)
- (en) Dennis E. Vance, Biochemistry of Lipids, Lipoproteins and Membranes, Elsevier, Amsterdam; Boston; Paris, 2002, 4e éd. (ISBN 0-444-51138-5)
Internet
* Portail Biochimie
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Biologie moléculaire - Génétique
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Biologie cellulaire
Bibliographie
- Biologie cellulaire de pollard et Earnshaw
- L'essentiel de la biologie cellulaire 2ème édition
- Biologie moléculaire de la cellule 4ème édition
Internet
* Portail Biologie cellulaire et moléculaire
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Bioinformatique - Génomique
Bioinformatique générale
Bibliographie
Internet
- ExPASy Proteomics Server
- Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes
- National Center for Biotechnology Information (NCBI)
- Online Informatics Resource for Dictyostelium
- Institut européen de bio-informatique : http://www.ebi.ac.uk/
- Ensembl (génomes complets séquencés) : http://www.ensembl.org/
- ReNaBI : French bioinformatics platforms network : http://www.renabi.fr/
- Génopole de Toulouse Mydi-Pyrénées : http://www.genotoul.fr/
- Centre de Ressources Infobiogen (CRI) : http://www.infobiogen.fr/
- PRABI : Rhone-Alpes Bioinformatics Center : http://www.prabi.fr
- Pôle Bio-Informatique Lyonnnais (PBIL) : http://pbil.univ-lyon1.fr/ | http://pbil.ibcp.fr/
- Société Française de BioInformatique
- Association des étudiants de la filière Bioinformatique d'Orsay
* Portail Biologie cellulaire et moléculaire
Logiciels, programmation et bases de données
Logiciels et programmation
- BLAST (recherche de séquences dans les bases de données) : http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/
- CLUSTAL W (alignement de séquences) : http://www.ebi.ac.uk/clustalw/
- DbClustal (alignement utilisant comme ancres les résultats de blast) : http://bips.u-strasbg.fr
- Bioinformatics.org (ensemble de projets libres) : http://www.bioinformatics.org
- The Open Bioinformatics Foundation (promotion de logiciels libres pour la bio-informatique) : http://open-bio.org/
- EMBOSS (ensemble d'outils libres pour l'analyse de séquences) : http://www.emboss.org/
- BioPerl (Perl et la bio-informatique) : http://bioperl.org
- BioPython (Python et la bio-informatique): http://biopython.org
- BioJava (Java et la bio-informatique): http://biojava.org
- Phylogène (initiation à la phylogénie): http://www.inrp.fr/Acces/biotic/evolut/phylogene/accueil.htm
- PHYML (logiciel de phylogénie) : http://atgc.lirmm.fr/phyml/
- Jmol (logiciel de visualisation de molécules en 3D) : http://www.jmol.org/
Bases de données
- EMBL (nucléotides): http://www.ebi.ac.uk/embl/
- GenBank (nucléotides): http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Genbank/index.html
- UniProt Knowledgebase (protéines): http://www.ebi.ac.uk/uniprot/
- SwissProt (protéines): http://www.expasy.org/
- PDB - The Protein DataBank (structures tridimensionnelles de macromolécules biologiques) : http://www.rcsb.org/pdb/
- The Genome Database : http://www.gdb.org/
- Ensembl martView : http://www.ensembl.org/Multi/martview
- EBI MartView : http://www.ebi.ac.uk/BioMart/martview
- WormBase http://www.wormbase.org/
- SGD (Saccharomyces Genome Database) : http://www.yeastgenome.org/
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