Candidatus Pelagibacter ubique

Pelagibacter ubique
Pelagibacter ubique
Classification
Règne	Bacteria
Embranchement	Proteobacteria
Classe	Alpha Proteobacteria
Ordre	Rickettsiales
— non-classé —	groupe SAR11
Genre
Candidatus Pelagibacter Rappé et al., 2002
Nom binominal
Candidatus Pelagibacter ubique Rappé et al., 2002

Candidatus Pelagibacter ubique est une petite alphaproteobacteria hétérotrophe, trouvée dans tous les océans. C'est peut-être la bactérie la plus représentée au monde (peut-être 10²⁸ cellules). Cette bactérie était à l'origine nommée SAR11 et connue seulement grâce à ses ARNr identifiés dans des échantillons de la mer des Sargasses en 1990. La bactérie a ensuite été isolée et décrite en 2002.

Composant du bactérioplancton, Candidatus Pelagibacter a une distribution mondiale. Très petite, elle a une longueur de 0,37-0,89 µm et un diamètre de seulement 0,12-0,20 µm.

Tout petit, le génome de Candidatus Pelagibacter est séquencé : il contient 1,3 Mpb et 1 354 gènes. Il n’y a pas d’introns, pas de transposons, pas de pseudogènes, pas d’éléments extragéniques, pas d’intéines et peu de paralogues.

Références

• Michael S. Rappé, Stephanie A. Connon, Kevin L. Vergin, Stephen J. Giovannoni (2002). "Cultivation of the ubiquitous SAR11 marine bacterioplankton clade". Nature 418: 630-633.
• R. M. Morris et al. (2002). "SAR11 clade dominates ocean surface bacterioplankton communities". Nature 420: 806 - 810.
• Stephen J. Giovannoni, H. James Tripp et. al (2005). "Genome Streamlining in a Cosmopolitan Oceanic Bacterium". Science 309: 1242-1245.

Liens externes

• Référence NCBI : Candidatus Pelagibacter (en)
• Référence NCBI : Candidatus Pelagibacter ubique Rappe et al. 2002 (en)

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