- Barcoding moléculaire
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Le barcoding moléculaire est une technique de phylogénétique qui permet de caractériser et de spécifier un individu ou un échantillon d'individu à partir d'un gène du génome mitochondrial, la cytochrome oxydase (COI). On l'utilise non pas tellement pour classer des individus d'espèces inconnues, mais plutôt pour détecter l'origine et l'identité d'un échantillon : par exemple, on peut analyser le cuir d'un sac à main pour savoir à partir de quelle espèce il a été produit ; ou identifier de quelle espèce de plante proviennent certaines feuilles, ou encore le régime d'un animal à partir de l'analyse du contenu de son estomac ou de ses selles.
Le marquage moléculaire au gène COI
Le gène COI est présent en de nombreuses copies, facilitant le séquençage. De plus, il « présente un niveau de variabilité intéressant : les différences entre les séquences de ce gène chez différents individus, apparues par mutations au cours du temps, sont faibles entre les individus d’une même espèce et élevées entre des individus d’espèces différentes[1]. »
Références
- Qu’est-ce qu’un barcode moléculaire ?, Institut français de l'éducation, mission SANTO 2006 Nicolas Puillandre,
Voir aussi
- Consortium for the Barcode of Life (en)
- Phylogénie moléculaire
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