TranscriptomeBrowser

TranscriptomeBrowser: TranscriptomeBrowser

TranscriptomeBrowser est un logiciel pour la fouille de données (data mining) de biopuces (cf; Genevestigator)^[1]. Il s'appuie sur une base de données contenant plusieurs dizaines de milliers de signatures transcriptionnelles (~ 20000) elles-mêmes issues de l'analyse systématiques de plusieurs centaines d'expériences (i.e; matrice d'expression). L'ensemble de la base contient environ 220 millions de valeurs d'expression qui peuvent être intérrogées via ue interface Java implémentant un moteur de recherche évolué.

Sommaire

1 Notes et références

2 Voir aussi

2.1 Articles connexes

2.2 Liens externes

Notes et références

↑ Lopez F Puthier D, « TranscriptomeBrowser: a powerful and flexible toolbox to explore productively the transcriptional landscape of the Gene Expression Omnibus database. », dans PLoS ONE, vol. 3, n^o 12, 23-12-2008, p. e4001 [texte intégral lien DOI]

Voir aussi

Articles connexes

Transcriptome

Genevestigator

Liens externes

TranscriptomeBrowser website.

Article (en anglais) sur les puces Affymetrix

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Catégorie : Ressource en biologie

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