Protéine membranaire

Protéine membranaire

Les protéines membranaires sont des protéines localisées au sein de la cellule au niveau d'une membrane (membrane plasmique, membranes des mitochondries). On distingue deux types de protéines membranaires selon leur localisation fine au niveau de la membrane, les protéines intrinsèques, intégrées dans la membrane, et extrinsèques, associées à la membrane. La quantité de gènes codant une protéine membranaire est estimée à environ 25 % du génome[1][réf. insuffisante]. Ce nombre très important reflète l'importance de cette classe de protéine, ainsi que la diversité des fonctions assurées, la plus fondamentale étant le lien entre le milieu extracellulaire et le milieu intracellulaire.

Sommaire

Classification des protéines membranaires

Topologies membranaires

Les protéines membranaires peuvent être classées en fonction des structures leur permettant d'interagir avec la membrane et la manière dont celles-ci s'agencent. Les types de structures mises en jeux et leurs organisations sont regroupés sous le terme de topologie membranaire.

Protéines polytopiques

Les différentes types de protéines membranaires polytopiques. La membrane est représentée en brun clair.
1. interaction par une hélice α hydrophobe transmembranaire ;
2. interaction par plusieurs hélices α hydrophobes transmembranaires ;
3. interaction par un tonneau β transmembranaires.

Les protéines polytopiques sont des protéines en contact avec les deux compartiments définis par la membrane. Les structures en contact avec la membrane peuvent être:

  • A. une ou plusieurs hélices α transmembranaires (de 1 à plus de 20 par protéine). Il s'agit de loin de la conformation transmembranaire la plus observée.
  • B. un tonneau β transmembranaire composé de 8 à 22 brins β[2].



Protéines monotopiques

Les différentes catégories de protéines membranaires monotopiques. La membrane est représentée en brun clair.
1. interaction par une hélices α amphipathique parallèle au plan de la membrane ;
2. interaction par un boucle hydrophobe ;
3. interaction par liaison covalent avec un lipide membranaire (lipidation) ;
4. interaction par liaison electrostatique directe ou indirecte (p.ex. via un ion calcium) avec les lipides membranaires;

Les protéines monotopiques sont des protéines en contact avec un seul des compartiments définis par la membrane. Les structures en contact avec la membranes peuvent être :

  • C. une ou plusieurs hélices α parallèle au plan de la membrane (de 1 à 3 par protéine). Ces hélices ont la particularité d'être amphipathique;
  • D. des boucles hydrophopes ;
  • E. des liaisons covalentes à un lipide, ou lipidation : il s'agit souvent de N-acylation N-terminale (liaison à un acide gras) ou de glipiation C-terminale (liaison à un glycosylphosphatidylinositol) ;
  • F. des liaisons électrostatiques à des lipides. Ces liaisons peuvent se faire directement avec des phospholipides ou par l'intermédiaire d'un ion ;


Classification biochimiques des protéines membranaires

Les protéines membranaires peuvent être classées en fonction de critères biochimiques, en particulier de leur difficulté à être extraite des membranes.

Protéines intégrales ou intrinsèques

Il s'agit de protéines mono- ou polytopiques interagissant fortement avec la membrane. Un détergent fort ou un solvant hydrophobe cassant la structure membranaire sont nécessaires pour les extraire.

Elle consiste premièrement à échanger l'eau avec du glycérol puis, à congeler la membrane cellulaire à grande vitesse et créer une réplique grâce à la microscopie électronique à balayage. On distinguera alors la face expolasmique(E) et la face protoplasmique(P). On observera les protéines traversant la membrane au microscope électronique à transmission.

Les premières protéines - dont les protéines intrinsèques - ont été identifiées sur les globules rouges à l'aide de la fixation de l'isotope radioactif 125 de l'Iode, fixation possible par la Lactoperoxydase. Il existe 5 classes de protéines intrinsèques : _ Type I: Glycophorine _ Type II: Type 1 renversé _ Type III: band 3 _ Type IV: band 3 dimériques _ Type V

Protéines périphériques ou extrinsèques

Ils s'agit de protéines monotopiques intéragissant faiblement avec la membrane, soit par liaisons électrostatiques , soit par l'intermédiaire d'autres protéines membranaires. Il n'est pas nécessaire de destructurer la membrane pour les extraire. Une force ionique élevée ou l'emploi d'un agent chaotropique peut suffire.

Rôles des protéines membranaires

Les fonctions des protéines membranaires peuvent être aussi variées que celle des protéines solubles : activités enzymatiques, fonctions structurales, moteurs moléculaires... En raison de leur localisation spécifique à l'interface de deux compartiments différents, les protéines intégrales de membrane peuvent cependant avoir plusieurs types de fonctions additionnelles tout à fait spécifiques :

  • Le transport actif ou passif de molécules à travers la membrane. Le transport est dit passif lorsque le composé diffuse simplement d'un côté à l'autre de la membrane. Le transport est au contraire actif quand il est couplé à une utilisation d'énergie par la protéine membranaire (hydrolyse d'ATP, utilisation de la force proton-motrice). Le transport actif permet de transporter une molécule contre son gradient de concentration.
  • la réception/transmission de signaux à travers la membrane (ex : hormones, neurotransmetteurs . . .)
  • le modelage et l'adhésion entre les membranes (jonctions serrées, ceintures d'adhérence . . .)
  • la reconnaissance intercellulaire (Glycoprotéines)
  • fixatation de la matrice extracellulaire
  • jouer un rôle enzymatique

Références

  1. ↑ (en) Stevens T.J. and Arkin I.T. (2000) Do more complex organisms have a greater proportion of membrane protein in their genomes?, Proteins, vol. 39(4):417-420
  2. ↑ (en) Schulz G.E. (2000) beta-Barrel membrane proteins, Curr Opin Struct Biol., vol. 266(4):761-775

Voir aussi


Wikimedia Foundation. 2010.

Contenu soumis à la licence CC-BY-SA. Source : Article Protéine membranaire de Wikipédia en français (auteurs)

Игры ⚽ Нужно решить контрольную?

Regardez d'autres dictionnaires:

  • Proteine membranaire — Protéine membranaire Les protéines membranaires sont des protéines retrouvés au sein de la membrane cellulaire. La quantité de gènes codant une protéine membranaire est estimée à environ 25% du génome[1]. Ce nombre très important reflète l… …   Wikipédia en Français

  • Proteine nef — Protéine nef Pour les articles homonymes, voir Nef (homonymie). La protéine nef est impliquée dans l infection par le VIH qui cause une déplétion progressive du nombre des lymphocytes CD4 et une altération de leur fonction, amenant à l… …   Wikipédia en Français

  • Proteine N du SRAS CoV — Protéine N du SRAS CoV La protéine N du SRAS CoV [1]est la protéine de la nucléocapside du coronavirus responsable du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS). Image:[2] Sommaire 1 Structure du SRAS CoV …   Wikipédia en Français

  • Protéine N SARS CoV — Protéine N du SRAS CoV La protéine N du SRAS CoV [1]est la protéine de la nucléocapside du coronavirus responsable du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS). Image:[2] Sommaire 1 Structure du SRAS CoV …   Wikipédia en Français

  • Protéine N de SRAS CoV — Protéine N du SRAS CoV La protéine N du SRAS CoV [1]est la protéine de la nucléocapside du coronavirus responsable du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS). Image:[2] Sommaire 1 Structure du SRAS CoV …   Wikipédia en Français

  • Proteine — Protéine Représentation schématique de la myoglobine. Cette protéine homologue de l hémoglobine se lie au dioxygène au niveau des muscles. Elle est la première dont la structure est résolue par cristallographie et diffraction des rayons X par Max …   Wikipédia en Français

  • Proteine transmembranaire — Protéine transmembranaire Schémas de trois types de protéines transmembranaires. La membrane est représentée en jaune. Une protéine est dite transmembranaire lorsqu elle traverse au moins une fois entièrement la membrane cellulaire. Il existe… …   Wikipédia en Français

  • Proteine phosphatase — Protéine phosphatase Les Protéines phosphatases sont des enzymes (phosphatases) qui déphosphorylent les sérines ou les thréonines des protéines [1],[2] On distingue : Les phosphoprotéines phosphatases 1 (PP1) qui sont spécifiques des… …   Wikipédia en Français

  • Protéine nef — Pour les articles homonymes, voir Nef (homonymie). La protéine nef est impliquée dans l infection par le VIH qui cause une déplétion progressive du nombre des lymphocytes CD4 et une altération de leur fonction, amenant à l immunodéficience… …   Wikipédia en Français

  • Protéine N du SRAS CoV — La protéine N du SARS CoV [1]est la protéine de la nucléocapside du coronavirus responsable du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS). Image:[2] Sommaire 1 Structure du SRAS CoV …   Wikipédia en Français

Share the article and excerpts

Direct link
… Do a right-click on the link above
and select “Copy Link”