Nomenclature des gènes de levure

Nomenclature des gènes de levure

Le nom des gènes de levure contient 3 lettres et jusqu’à 3 chiffres : RHO1, RAD21… Le choix de ces 3 lettres est souvent lié à la fonction du gène.

Le gène sauvage est écrit en majuscule et en italique : RHO1, RAD21…

Les gènes portant une mutation récessive sont écrits en minuscule et en italique : rho1, rad21.

Les allèles mutants sont représentés par un tiret et un nombre : rho1-23, rad21-456.

Le produit d’un gène (la protéine) est écrit avec une lettre majuscule suivie de deux minuscules sans italique. Un p est souvent ajouté à la fin : Rho1p, Rad21p

Enfin, de nombreux gènes identifiés lors du séquençage du génome restent sans fonction connue. Ils sont nommés YDR518C, YML016W…, avec:

  • Y pour ”yeast”
  • La deuxième lettre désigne le chromosome (D=IV, M=XIII....)
  • L ou R désigne le bras droit (Right) ou gauche (Left) du chromosome.
  • Les trois chiffres correspondent au n° de la phase ouverte de lecture (ORF) compté à partir du centromère.
  • C et W indiquent si l’ORF est transcrite sur le brin ”Crick” ou ”Watson”
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