Neighbour joining
- Neighbour joining
-
En bio-informatique, le neighbour joining est une méthode d'élaboration d'arbres de données phylogénétiques. La méthode neighbour joining se base sur les mêmes principes que les méthodes d'analyse de groupe (cluster analysis), telles que la méthode de UPGMA (qui se base sur les distances génétiques pour construire un arbre phylogénétique). La seule différence de la méthode de neighbour joining est qu'elle tient compte des différences de vitesse d'évolution entre les différentes branches de l'arbre phylogénétique. Cette méthode fournit un arbre non polarisé (non enraciné).
Utilisée généralement pour les arbres de données basés sur l'ADN ou les séquences de protéines, l'algorithme requiert la connaissance de la distance entre chaque paire de taxons (par. ex. espèces ou séquences) dans l'arbre.
Références
Wikimedia Foundation.
2010.
Contenu soumis à la licence CC-BY-SA. Source : Article Neighbour joining de Wikipédia en français (auteurs)
Regardez d'autres dictionnaires:
Neighbour Joining — En bioinformatique, le neighbour joining est une méthode d élaboration d arbres de données phylogénétiques. La méthode neighbour joining se base sur les mêmes principes que les méthodes d analyse de groupe (cluster analysis), telles que la… … Wikipédia en Français
Neighbour-joining — In diesem Artikel oder Abschnitt fehlen folgende wichtige Informationen: Hier müssen einfach noch viel mehr Infos rein. Das Beispiel muss noch weitergeführt werden. Bilder sollten das Ganze verständlich darstellen (ungewurzelte additive Bäume… … Deutsch Wikipedia
Neighbour joining — In diesem Artikel oder Abschnitt fehlen folgende wichtige Informationen: Hier müssen einfach noch viel mehr Infos rein. Das Beispiel muss noch weitergeführt werden. Bilder sollten das Ganze verständlich darstellen (ungewurzelte additive Bäume… … Deutsch Wikipedia
Neighbour-Joining-Algorithmen — In diesem Artikel oder Abschnitt fehlen folgende wichtige Informationen: Hier müssen einfach noch viel mehr Infos rein. Das Beispiel muss noch weitergeführt werden. Bilder sollten das Ganze verständlich darstellen (ungewurzelte additive Bäume… … Deutsch Wikipedia
Neighbor joining — This genetic distance map made in 2002 is an estimate of 18 world human groups by a neighbour joining method based on 23 kinds of genetic information. It was made by Saitou Naruya (斎藤成也? … Wikipedia
Neighbor-Joining-Algorithmus — Der Neighbor Joining Algorithmus ist ein mathematisches Verfahren, um Datensätze zu vergleichen und hierarchisch bifurcal (zweigabelig) anzuordnen. Dieses Verfahren wurde 1987 von Saitou und Nei vorgestellt und 1988 von Studier und Keppler… … Deutsch Wikipedia
Neighbor-Joining-Verfahren — In diesem Artikel oder Abschnitt fehlen folgende wichtige Informationen: Hier müssen einfach noch viel mehr Infos rein. Das Beispiel muss noch weitergeführt werden. Bilder sollten das Ganze verständlich darstellen (ungewurzelte additive Bäume… … Deutsch Wikipedia
UPGMA — Unweighted Pair Group Method with Arithmetic mean (kurz UPGMA) bezeichnet eine Bottom Up Clustering Methode. Sie wird oft in der Bioinformatik zur Rekonstruktion phylogenetischer Bäume angewendet. Im Gegensatz zu anderen Verfahren wie Neighbour… … Deutsch Wikipedia
Unweighted Pair Group Method — with Arithmetic mean (kurz UPGMA) bezeichnet eine Bottom Up Clustering Methode. Sie wird oft in der Bioinformatik zur Rekonstruktion phylogenetischer Bäume angewendet. Im Gegensatz zu anderen Verfahren wie Neighbour Joining basiert UPGMA auf der… … Deutsch Wikipedia
WPGMA — Unweighted Pair Group Method with Arithmetic mean (kurz UPGMA) bezeichnet eine Bottom Up Clustering Methode. Sie wird oft in der Bioinformatik zur Rekonstruktion phylogenetischer Bäume angewendet. Im Gegensatz zu anderen Verfahren wie Neighbour… … Deutsch Wikipedia
Portail de l’origine et de l’évolution du vivant
Portail de la biologie
Portail de l’informatique
