SIMAP

SIMAP

Similarity Matrix of Proteins

Similarity Matrix of Proteins, ou SIMAP, est une base de données de similitude entre protéines et des domaines protéiniques. Celle-ci rassemble toutes les séquences de protéines actuellement publiées et est continuellement mise à jour. Les similitudes entre protéines sont calculées à l'aide de l'algorithme FASTA qui fournit une vitesse optimale et une sensibilité nécessaire. Les domaines de protéines sont calculés en utilisant la base de données et les méthodes d'InterPro.

SIMAP est un projet commun du centre national de recherches GSF pour l'environnement et la santé, de l'université technique de Munich, et du centre de la vie et des sciences de l'alimentation Weihenstephan. L'utilisation des résultats de SIMAP est entièrement libre pour l'éducation et la recherche publique.

SIMAP utilise la plateforme de calcul distribué BOINC. Grâce à l'utilisation de BOINC, chacun peut participer, avec son ordinateur personnel, à la mise à jour continue de la base de donnée.


Statistiques de SIMAP au 7 janvier 2008:

Élément Nombre
Bases de données 590
Protéines 32 036 999
Séquences 18 167 030
Acides aminés 4 191 546 191

Voir aussi

Liens internes

Liens externes

  • Portail de la biochimie Portail de la biochimie
  • Portail de la biologie cellulaire et moléculaire Portail de la biologie cellulaire et moléculaire
  • Portail de l’informatique Portail de l’informatique
Ce document provient de « Similarity Matrix of Proteins ».

Wikimedia Foundation. 2010.

Contenu soumis à la licence CC-BY-SA. Source : Article SIMAP de Wikipédia en français (auteurs)

Игры ⚽ Нужна курсовая?

Regardez d'autres dictionnaires:

  • SIMAP — Saltar a navegación, búsqueda SIMAP (del inglés SImiliarity MAtrix of Proteins, o matriz de similitud de proteínas) es una base de datos de similitudes entre proteínas creada usando computación distribuida, y que es libremente accesible para… …   Wikipedia Español

  • SIMAP — SIMAP@home Bereich: Biochemie Ziel: Berechnung der Ähnlichkeit von Proteinsequenzen und Speicherung in einer Datenbank Betreiber: GSF National Research Center for Environment and Health, Neuherberg TU München, Center of Life and Food Science,… …   Deutsch Wikipedia

  • SIMAP — sigla Servizio di Igiene Mentale e Assistenza Psichiatrica …   Dizionario italiano

  • SIMAP — Similarity Matrix of Proteins, or SIMAP, is a database of protein similarities created using distributed computing, which is freely accessible for scientific purposes. SIMAP uses the FASTA algorithm to precalculate protein similarity, while… …   Wikipedia

  • SIMAP@home — SIMAP Тип Распределённые вычисления Операционная система Кроссплатформенное ПО Аппаратная платформа x86 Последняя версия • simap (Windows): 5.10 • simap (Windows x64): 5.12 …   Википедия

  • SIMAP — • The Oil and Chemical Spill Impact and Assessment Model System …   Maritime acronyms and abbreviations

  • Sindicato de Médicos de Asistencia Pública — El Sindicato de Médicos de Asistencia Pública, abreviado SIMAP[1] es un sindicato de médicos que trabajan en la sanidad pública, siendo su ámbito territorial las tres provincias que forman la Comunidad Valenciana. Contenido 1 Historia 2… …   Wikipedia Español

  • Similarity Matrix of Proteins — Similarity Matrix of Proteins, ou SIMAP, est une base de données de similitude entre protéines et des domaines protéiniques. Celle ci rassemble toutes les séquences de protéines actuellement publiées et est continuellement mise à jour. Les… …   Wikipédia en Français

  • Anwesenheitsbereitschaft — Bereitschaftsdienst (in der Schweiz auch Pikettdienst genannt) ist die Zeitspanne, während der sich der Arbeitnehmer, ohne dass er unmittelbar am Arbeitsplatz anwesend sein müsste, sich für Zwecke des Betriebes an einer vom Arbeitgeber bestimmten …   Deutsch Wikipedia

  • Bereitschaftsdienst — (in der Schweiz auch Pikettdienst genannt) ist die Zeitspanne, während der sich der Arbeitnehmer, ohne dass er unmittelbar am Arbeitsplatz anwesend sein müsste, sich für Zwecke des Betriebes an einer vom Arbeitgeber bestimmten Stelle innerhalb… …   Deutsch Wikipedia

Share the article and excerpts

Direct link
Do a right-click on the link above
and select “Copy Link”